结论：甲方是否可以不付二期工程款，不能仅凭乙方违约拖延工期这一单一因素直接决定，需结合合同具体条款、违约程度及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、合同条款的约定是首要依据
付款条件与工期挂钩：若合同中明确约定“乙方未按约定工期完成工程，甲方有权暂停支付后续工程款”或类似条款，则甲方在乙方违约拖延工期时，有权依据合同拒绝支付二期工程款。但需注意，此类条款需符合法律法规的强制性规定，不得显失公平或违反公序良俗。
违约责任与救济方式：合同中若规定了乙方违约时甲方可采取的救济方式，如扣除违约金、要求赔偿损失等，且未明确排除甲方暂停支付工程款的权利，则甲方在乙方违约时，可结合合同约定及实际损失情况，选择是否暂停支付二期工程款。
二、违约程度与因果关系是关键考量
违约的严重性：若乙方拖延工期导致甲方遭受重大损失，如错过市场机遇、产生额外费用等，且该损失与乙方违约行为存在直接因果关系，则甲方有权依据《民法典》中关于违约责任的规定，要求乙方承担赔偿责任，并可能因此拒绝支付二期工程款，直至乙方赔偿损失或采取补救措施。
违约的轻微性：若乙方拖延工期时间较短，未对甲方造成实质性损失，或甲方能够通过其他方式弥补损失，则甲方拒绝支付二期工程款的理由可能不充分，需考虑继续履行合同或协商解决。
三、法律规定的限制与保护
同时履行抗辩权：根据《民法典》的相关规定，若双方互负债务，没有先后履行顺序的，应当同时履行。一方在对方履行之前有权拒绝其履行请求。但在建设工程合同中，通常存在明确的付款与施工顺序，因此同时履行抗辩权的适用需谨慎。不过，若乙方未履行主要债务（如完成工程），甲方有权拒绝支付相应工程款。
不安抗辩权：若甲方有确切证据证明乙方有丧失或者可能丧失履行债务能力的情形（如经营状况严重恶化、转移财产等），甲方可以中止履行合同，包括暂停支付工程款。但需及时通知乙方，并在乙方提供担保或恢复履行能力后恢复履行。
四、实际操作建议
审查合同条款：甲方应首先审查合同中关于付款条件、工期、违约责任等条款的约定，明确自身权利与义务。
评估违约程度与损失：甲方需评估乙方拖延工期对自身造成的实际损失，以及乙方违约的严重程度，为决定是否暂停支付工程款提供依据。
协商与沟通：在采取法律行动前，甲方可尝试与乙方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案，如延长工期、扣除部分工程款作为违约金等。
法律途径：若协商无果，甲方可依据合同约定及法律规定，通过诉讼或仲裁等法律途径维护自身权益，要求乙方承担违约责任并赔偿损失。
总结：甲方是否可以不付二期工程款，需结合合同条款、违约程度及法律规定综合判断。在处理此类纠纷时，建议甲方保持冷静，依法行事，并在必要时寻求专业律师的帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。