结论：通常情况下，不建议在工伤认定申请交上去后才去申请劳动仲裁确认劳动关系，而是建议在申请工伤认定前，先通过劳动仲裁确认劳动关系（若存在争议），以确保工伤认定申请的顺利进行。
详细分析
工伤认定与劳动关系确认的关联性
- 工伤认定是以存在劳动关系为前提的。根据《工伤保险条例》及相关规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。但这一认定的基础是职工与用人单位之间存在劳动关系。
- 如果劳动关系存在争议，如未签订劳动合同、用人单位否认劳动关系等，那么在申请工伤认定前，需要先通过劳动仲裁确认劳动关系。
申请工伤认定与劳动仲裁的顺序
- 理想顺序：在存在劳动关系争议的情况下，职工应先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，确认与用人单位存在劳动关系。待仲裁裁决确认劳动关系后，再向社会保险行政部门申请工伤认定。
- 实际操作中的风险：如果职工先申请工伤认定，而劳动关系存在争议，社会保险行政部门可能会要求职工先确认劳动关系，导致工伤认定申请被中止或退回。这不仅会延长工伤认定的时间，还可能影响职工的权益保障。
特殊情况下的处理
- 如果用人单位对劳动关系无异议，或者职工能够提供充分的证据证明与用人单位存在劳动关系（如工资单、工作证、同事证言等），那么可以直接申请工伤认定，无需先通过劳动仲裁确认劳动关系。
- 如果职工在申请工伤认定后，才发现劳动关系存在争议，此时可以及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，确认劳动关系。但需要注意的是，这可能会影响工伤认定的进度和结果。
法律建议
- 提前准备：职工在遭受工伤后，应尽快收集与用人单位存在劳动关系的证据，如劳动合同、工资单、工作证等。
- 及时咨询：如果劳动关系存在争议，或者对工伤认定流程不熟悉，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律程序和注意事项。
- 合理规划：根据自身情况，合理规划申请工伤认定和劳动仲裁的顺序，以确保自身权益得到及时有效的保障。
示例说明
假设职工A在工作时间和工作场所内因工作原因受到事故伤害，但用人单位否认与A存在劳动关系。此时，A应先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，确认与用人单位存在劳动关系。待仲裁裁决确认劳动关系后，A再向社会保险行政部门申请工伤认定。这样，可以确保工伤认定申请的顺利进行，避免因劳动关系争议而导致的延误和风险。
有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，提供更详细的法律建议和帮助。