结论：因变造学历导致劳动合同无效的，劳动者已赚取的工资原则上无需退还，但若因劳动者欺诈行为给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求赔偿；同时，用人单位有权解除劳动合同且无需支付经济补偿。以下从法律后果、工资处理、赔偿问题及实务建议四个角度展开分析：

一、变造学历对劳动合同效力的影响

根据《劳动合同法》第二十六条，以欺诈手段使对方在违背真实意思的情况下订立劳动合同的，劳动合同无效。变造学历属于典型的欺诈行为，用人单位可据此主张合同无效，并解除劳动关系。实务中，法院通常认定此类合同自始无效，但劳动者已提供的劳动仍需获得报酬。

二、已赚取工资的处理原则

1. 劳动报酬权受保护
   根据《劳动合同法》第二十八条，劳动合同被确认无效后，劳动者已付出劳动的，用人单位应参照本单位相同或相近岗位劳动者的劳动报酬支付工资。即使合同无效，劳动者仍有权获得与其实际劳动对应的报酬，无需退还已发放的工资。
   例：劳动者变造学历入职后实际从事文员工作，用人单位需按文员岗位标准支付工资，而非以“学历不符”为由拒付或追回工资。

2. 例外情形：恶意串通或重大过失
   若劳动者通过变造学历获取远超其实际能力的岗位（如无医学背景者冒充医生），且用人单位能证明劳动者存在主观恶意或重大过失，可能通过诉讼主张部分工资返还。但此类案件举证难度极高，实务中法院极少支持用人单位追回工资的诉求。

三、用人单位的赔偿请求权

1. 直接经济损失赔偿
   根据《劳动合同法》第八十六条，因劳动者过错导致劳动合同无效并给用人单位造成损失的，劳动者应承担赔偿责任。赔偿范围限于用人单位因欺诈行为直接产生的损失，如：

   • 招聘成本（如猎头费、背景调查费）；
     
   • 培训费用（如专项技能培训支出）；
     
   • 岗位空缺期间的额外支出（如临时用工费用）。
     例：用人单位为招聘某岗位支付猎头费5万元，因劳动者变造学历导致合同无效，法院可能支持用人单位主张该5万元赔偿。

2. 间接损失不予支持
   用人单位主张的“预期利益损失”（如因劳动者能力不足导致的业务亏损）通常不被法院认可，因该损失与欺诈行为无直接因果关系，且难以量化。

四、实务建议

1. 对劳动者的建议

   • 主动沟通：若已变造学历入职，建议尽快向用人单位坦白并协商解决方案（如调岗、降薪），避免被解除合同且承担赔偿风险。
     
   • 保留证据：若用人单位以“学历不符”为由克扣工资，可收集考勤记录、工作成果等证据，通过劳动仲裁主张工资差额。

2. 对用人单位的建议

   • 完善招聘流程：在入职前严格核查学历、工作经历等关键信息，要求劳动者签署《诚信承诺书》，明确欺诈行为的法律后果。
     
   • 及时固定证据：发现劳动者变造学历后，立即留存学历证书复印件、背景调查报告等证据，并通过书面形式通知劳动者解除合同。
     
   • 合理主张赔偿：若因劳动者欺诈遭受实际损失，需在解除合同后1年内提起劳动仲裁，并提交损失计算依据（如发票、合同等）。

总结：变造学历导致合同无效的，劳动者无需退还工资，但可能面临赔偿风险；用人单位可解除合同并追责，但需以实际损失为限。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。