针对您提出的“五座营运车超载12个（这里理解为超载人数达到或超过车辆核定载客数的20%，即超载1人或以上，但以具体超载12个的严重情况为基准进行说明，实际处罚会依据超载的具体比例）怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规给出的详细解答：
一、处罚依据
处罚主要依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》和《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定。
二、具体处罚措施
扣分：
- 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶营运载客汽车（不包括公共汽车）载人超过核定人数20%以上的，将面临一次记6分的处罚。在您的情况下，五座营运车超载12个（假设原核定载客数为5人，则超载比例远超20%），因此会记6分。
罚款：
- 依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；若超载达到或超过20%，则罚款提升至五百元以上二千元以下。对于您的情况，由于超载比例极高，将适用五百元以上二千元以下的罚款标准。具体罚款数额会根据超载的严重程度、地区差异以及交警部门的裁量权来确定。
三、特别提醒与危害分析
- 超载的危害：车辆超载是极其危险的交通违法行为，它会严重影响车辆的制动性能、操控性能等，从而大大增加交通事故发生的风险。超载不仅危及驾驶员和乘客的生命安全，还可能对其他道路使用者造成威胁。
- 严格遵守交通法规：为了确保行车安全，请严格遵守交通法规，切勿超载行驶。作为营运车辆的驾驶员，您更应认识到超载的严重性，自觉维护道路交通秩序和安全。
- 法律后果的严重性：超载行为不仅会导致扣分和罚款，还可能面临更严厉的法律后果，如停运整顿、吊销运营资格等。这些后果将严重影响您的职业发展和生活。
四、综合建议
- 避免超载：在每次出车前，请务必检查车辆载客情况，确保不超载行驶。
- 加强安全意识：提高安全意识，认识到超载的危害性，自觉遵守交通法规。
- 配合执法：如果遇到交警检查，请积极配合执法工作，如实说明情况，接受处罚并改正错误。
综上所述，五座营运车超载12个将面临严重的法律后果，包括扣分和罚款等。为了您和他人的生命安全，请务必严格遵守交通法规，切勿超载行驶。