行政医疗事故鉴定一般由设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会负责组织首次鉴定，必要时，中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作。具体分析如下：

鉴定机构的选择与层级

1. 首次鉴定机构：根据《医疗事故处理条例》第二十一条，设区的市级地方医学会和省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会负责组织首次医疗事故技术鉴定工作。这意味着，在大多数情况下，患者或医疗机构应首先向这些机构申请鉴定。
2. 再次鉴定机构：如果对首次鉴定结论不服，可以在收到首次鉴定结论之日起15日内，向医疗机构所在地卫生行政部门提出再次鉴定的申请。根据条例，省、自治区、直辖市地方医学会负责组织再次鉴定工作。
3. 特殊情况下的鉴定机构：对于疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议，必要时，中华医学会可以组织技术鉴定工作。

鉴定流程与注意事项

1. 提交申请：患者或医疗机构应向相应的医学会提交医疗事故技术鉴定申请，并附上相关病历资料、证明文件等。
2. 缴纳鉴定费：根据规定，医学会在受理鉴定申请后，会通知双方当事人缴纳鉴定费。鉴定费的缴纳是鉴定程序进行的前提。
3. 组成鉴定组：医学会在收到鉴定费后，会组织专家库中的专家组成鉴定组，负责具体的鉴定工作。鉴定组应由具备相关专业知识和经验的专家组成，以确保鉴定的公正性和准确性。
4. 进行鉴定：鉴定组在受理鉴定后，会按照规定的程序和要求进行鉴定工作。这包括查阅病历资料、听取双方当事人的陈述和答辩、进行必要的现场勘查和调查等。
5. 出具鉴定报告：鉴定组在完成鉴定工作后，会出具医疗事故技术鉴定报告。该报告应详细阐述鉴定的过程、结果和结论，并作为处理医疗事故争议的重要依据。

特殊情况下的处理

1. 当事人拒绝配合：如果一方当事人拒绝配合鉴定工作，如拒绝提供病历资料、拒绝参加现场勘查等，这可能会影响鉴定的进行和结果的公正性。在这种情况下，医学会可能会根据相关规定作出处理，如终止鉴定程序或作出不利于拒绝配合方的鉴定结论。
2. 鉴定结论的异议：如果对鉴定结论有异议，可以在收到鉴定报告之日起一定期限内（如15日内）向医学会提出书面异议，并申请重新鉴定或补充鉴定。医学会在收到异议后，会组织专家进行复核，并根据复核结果作出相应的处理。