根据《反不正当竞争法》，违法收入的处理方式主要包括没收违法所得，并可处以罚款；若构成犯罪，还将依法追究刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚层面
   根据《反不正当竞争法》第二十一条，经营者违反规定实施混淆行为、商业贿赂、虚假宣传等不正当竞争行为的，由监督检查部门责令停止违法行为，没收违法所得，并处以违法经营额一倍以上三倍以下罚款（违法经营额不足五万元的，处五万元以上二十五万元以下罚款）；情节严重的，吊销营业执照。例如，若企业通过虚假宣传获得违法收入100万元，监管部门可没收该100万元，并处100万至300万元罚款。

2. 民事赔偿层面
   若违法收入涉及侵犯他人商业秘密、商业诋毁等行为，受害方可依据《反不正当竞争法》第十七条要求赔偿。赔偿范围包括实际损失、侵权人违法所得（二者择一），或参照权利使用费倍数确定。例如，企业通过盗用商业秘密获利200万元，受害方可主张赔偿200万元及合理维权费用。

3. 刑事责任层面
   若不正当竞争行为同时触犯《刑法》，如构成损害商业信誉罪、侵犯商业秘密罪等，将依法追究刑事责任。此时违法收入可能作为量刑依据，例如侵犯商业秘密罪中，违法所得数额巨大或造成特别严重后果的，可处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

实务建议：

• 企业应定期自查广告宣传、商业合作等环节，避免使用“最高级”“独家”等绝对化用语或虚假数据；
  
• 若被监管部门调查，需积极配合并提供完整财务记录，争取从轻处理；
  
• 涉及民事赔偿时，建议通过协商或诉讼固定证据，避免因举证不足导致赔偿金额降低。
  

如有具体案件细节（如违法收入金额、行为类型等），可进一步向我咨询，我会结合案例为您分析风险点及应对策略。