建材商贸公司和建筑公司同一个法人代表，是可以进行交易的，但需要注意遵守相关法律法规，确保交易的合法性和合规性。以下从几个关键角度为你详细分析：

一、法人代表的角色与责任

法人代表是公司法律行为的代表，有权代表公司签订合同、进行交易等。同一个法人代表代表两家不同的公司进行交易，并不违反法律规定。但关键在于，法人代表在代表每家公司时，必须明确其代表的身份和权限，确保交易行为符合该公司的利益，且不损害其他股东或债权人的利益。

二、关联交易的合规性

当建材商贸公司和建筑公司存在关联关系（如同一法人代表）时，它们之间的交易可能被视为关联交易。关联交易本身并不违法，但必须遵守相关法律法规，确保交易的公平、公正和透明。具体来说：

1. 信息披露：关联交易应当在公司的财务报告或相关公告中充分披露，以便股东和债权人了解交易的真实情况。
2. 公平交易：关联交易的价格、条件等应当与市场水平相当，不得利用关联关系损害公司或其他股东的利益。
3. 程序合规：关联交易应当经过公司内部决策程序的批准，如董事会或股东会的决议，确保交易符合公司的利益。

三、潜在的法律风险与防范

尽管同一个法人代表代表两家公司进行交易并不违法，但仍存在一些潜在的法律风险，如：

1. 利益冲突：法人代表可能面临利益冲突的问题，即如何平衡两家公司的利益。为防范这一风险，法人代表应当确保在代表每家公司时，都以该公司的利益为出发点，避免偏袒或损害其中一方的利益。
2. 法律责任：如果关联交易存在违法违规行为，如价格欺诈、利益输送等，法人代表可能面临法律责任。因此，在进行关联交易时，必须确保交易的合法性和合规性。

四、实际操作建议

1. 明确交易条款：在签订交易合同时，应当明确交易的价格、条件、支付方式等关键条款，确保交易的透明度和公平性。
2. 保留交易记录：应当妥善保留与关联交易相关的所有文件和记录，如合同、发票、付款凭证等，以备查证。
3. 寻求专业意见：在进行复杂的关联交易时，建议寻求专业律师或会计师的意见，确保交易的合法性和合规性。

总结来说，建材商贸公司和建筑公司同一个法人代表是可以进行交易的，但必须遵守相关法律法规，确保交易的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。