结论：违约金已付并不直接等同于不算逾期，是否逾期需根据合同的具体约定以及实际履行情况来判断。以下从不同角度进行分析：
合同约定的角度：
- 逾期定义：首先，要查看合同中是否明确规定了“逾期”的定义。有些合同可能将“逾期”定义为未在约定时间内履行付款义务，而有些合同可能对此有更为宽泛或具体的解释。
- 违约金与逾期关系：合同中可能规定，一旦逾期，违约方需支付违约金。但这并不意味着支付了违约金就消除了逾期的事实。违约金更多是对违约行为的一种经济制裁，而非对逾期状态的改变。
- 特殊条款：有些合同可能包含特殊条款，如“支付违约金后，逾期状态视为消除”或类似表述。如果合同中有这样的规定，那么支付违约金后，可能不再被视为逾期。但这种情况较为少见，且需严格依据合同条款来判断。
实际履行情况的角度：
- 付款时间：即使支付了违约金，如果付款时间仍然晚于合同约定的时间，那么从实际履行的角度来看，仍然构成逾期。
- 对方接受情况：如果对方在收到违约金后，明确表示接受并认为逾期问题已解决，且双方没有因此产生争议，那么在实际操作中，可能可以视为逾期问题已得到处理。但这种处理方式缺乏法律上的明确依据，更多是基于双方的协商和妥协。
法律后果的角度：
- 逾期责任：无论是否支付了违约金，如果构成逾期，违约方仍可能需要承担逾期责任，如支付逾期利息、赔偿损失等。
- 合同解除权：在某些情况下，如果逾期严重到构成根本违约，对方可能享有合同解除权。支付违约金并不自动消除对方的这一权利。
建议：
- 审查合同：首先，仔细审查合同中的相关条款，特别是关于逾期、违约金以及双方权利义务的规定。
- 沟通协商：如果双方对逾期问题存在争议，建议及时沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 法律途径：如果协商无果，且认为自己的权益受到侵害，可以考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
示例：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定甲应在某日前支付货款，逾期则需支付违约金。后甲因故逾期支付，但随后支付了违约金。如果合同中没有特殊条款规定支付违约金后逾期状态视为消除，那么从法律角度来看，甲仍然构成逾期，可能需要承担逾期责任。但如果乙在收到违约金后明确表示接受并认为逾期问题已解决，且双方没有因此产生争议，那么在实际操作中可能可以视为逾期问题已得到处理。不过，这种处理方式并不具有普遍适用性，具体还需根据合同条款和实际情况来判断。
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