关于城里道路车辆超限的处罚主体问题，结论前置如下：
一般情况下，由公安机关交通管理部门负责处罚。这是基于《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，该法明确了公安机关交通管理部门是道路交通安全管理的主体，有权对超限等交通违法行为进行处罚。
特定情况下，可能涉及其他部门的联合执法或移送处理。例如，如果超限行为同时涉及车辆改装、非法营运等违法行为，公安机关交通管理部门在处罚后，可能会将案件移送至交通运输管理部门或其他相关部门进行进一步处理。
详细解释与法律依据：
公安机关交通管理部门的处罚权：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第八十七条：“公安机关交通管理部门及其交通警察对道路交通安全违法行为，应当及时纠正。公安机关交通管理部门及其交通警察应当依据事实和本法的有关规定对道路交通安全违法行为予以处罚。对于情节轻微，未影响道路通行的，指出违法行为，给予口头警告后放行。”
- 这意味着，对于城里道路上的车辆超限行为，公安机关交通管理部门有权进行查处，并根据违法情节的轻重，给予相应的处罚，如罚款、记分、扣留车辆等。
特定情况下的联合执法或移送处理：
- 如果超限行为不仅违反了道路交通安全法规，还涉及其他法律法规的违反，如车辆改装未报批、非法营运等，那么公安机关交通管理部门在处罚后，可能会根据案件性质，将案件移送至交通运输管理部门、工商行政管理部门或其他相关部门进行进一步处理。
- 例如，根据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，对于非法营运的车辆，交通运输管理部门有权进行查处，并给予相应的行政处罚。
实际执法中的注意事项：
- 测速与取证：公安机关交通管理部门在查处超限行为时，通常会使用测速设备、移动测速仪或区间测速系统来记录超速事实。因此，驾驶员在行驶过程中应注意观察道路限速标志，避免超速行驶。
- 违法通知与处罚执行：一旦被查处超限行为，驾驶员会收到交警部门通过短信、邮寄等方式告知的违法详情及处理期限。驾驶员需在规定时间内缴纳罚款、完成记分处理，逾期将产生滞纳金或影响信用记录。
- 多次违法与从重处罚：如果驾驶员多次超限违法，可能会被列入重点监管名单，接受更严格的执法检查。同时，超速行为若伴随其他交通违法行为（如酒驾、毒驾），将面临合并处罚。
建议与提醒：
- 驾驶员应严格遵守道路交通安全法规，注意道路限速标志，避免超速行驶带来的法律后果和安全风险。
- 如果对处罚有异议或认为处罚不当，驾驶员可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。
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