在民间借贷纠纷中，若二审生效时间是2025年9月28日，申请再审的期限通常是自判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。以下是对这一结论的详细解释和可能涉及的其他情况：
一、一般规定
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审。申请再审的期限通常是自判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。这是申请再审的一般期限规定，适用于大多数情况。
二、特殊情形下的期限延长
有新证据的情况：
- 如果当事人有新的证据，足以推翻原判决、裁定的，可以在知道或者应当知道该证据之日起六个月内提出再审申请。但这一期限仍然受到原判决、裁定生效后六年内（对于可能判处死刑的案件或者可能判处无期徒刑的案件，为十年内）的限制。不过，在民间借贷纠纷中，这种情况相对较少见。
法院自行决定再审或检察院抗诉的情况：
- 如果法院自行决定再审或者检察院提出抗诉，那么再审的启动将不受上述六个月期限的限制。但这种情况通常不是由当事人直接申请再审触发的，而是由法院或检察院基于特定原因主动启动的。
三、申请再审的注意事项
及时提出申请：
- 当事人应当在规定的期限内及时提出再审申请，以免丧失申请再审的权利。如果逾期提出，法院将不予受理，除非存在特殊情形且经法院审查同意。
准备充分的证据和理由：
- 当事人在提出再审申请时，应当准备充分的证据和理由，以证明原判决、裁定存在错误。这包括但不限于新的证据、法律适用错误、程序违法等。
遵循法定程序：
- 当事人在提出再审申请时，应当遵循法定的程序和要求，如提交再审申请书、相关证据材料等。如果程序不符合要求，法院可能不予受理或者驳回申请。
四、法律后果
- 如果当事人在规定的期限内提出再审申请，且法院经审查认为符合再审条件，那么法院将裁定再审，并重新审理案件。这可能导致原判决、裁定的撤销或变更。
- 如果当事人逾期提出再审申请或者法院经审查认为不符合再审条件，那么法院将不予受理或者驳回申请。此时，原判决、裁定将继续有效，当事人需要履行相应的义务。