当国土资源局通过航拍技术发现农村存在疑似违建情况时，其处理流程是严谨且合法的，主要目的是确保土地资源的合理利用和城乡规划的有效实施。针对您提出的“农村航拍到的违建怎么处理，是否会罚款”的问题，以下是我为您详细梳理的处理流程及可能的处罚措施：
一、调查核实与取证阶段
资料收集：国土资源局会首先收集航拍影像、土地权属证明、规划许可文件等相关资料，以明确建筑物的土地性质、建设是否合法等关键信息。
现场勘查：随后，工作人员会赴现场进行实地勘查，详细记录建筑物的面积、结构、用途等具体情况，并与前期收集的资料进行比对核实。
证据固定：通过拍照、录像等方式，对违建现场进行证据固定，确保后续处理的准确性和合法性。
二、认定违建并下达法律文书
若经过调查核实，确认存在违建行为，国土资源局会向当事人发出《违法建筑认定书》或类似法律文书，明确告知其违建事实和法律依据。同时，对于正在建设中的违建，还会下达《责令停止违法行为通知书》，要求当事人立即停止建设行为。
三、作出处罚决定
在完成调查取证后，国土资源局会向当事人送达《行政处罚告知书》，详细列明拟作出的行政处罚内容，这可能包括限期拆除、没收违法建筑物、罚款等。同时，会告知当事人享有的陈述、申辩和要求听证的权利。
四、执行处罚决定
自行履行：当事人在收到《行政处罚决定书》后，应在规定期限内自行履行处罚决定，如自行拆除违法建筑物、缴纳罚款等。
强制执行：若当事人在法定期限内既不申请行政复议或提起行政诉讼，又不履行处罚决定的，国土资源局将采取强制措施，包括催告当事人履行义务，以及向有管辖权的人民法院申请强制执行。
五、后续监管与总结提升
违建处理完毕后，国土资源局会持续监管该地块，防止再次出现违法建设行为。同时，还会总结违建产生的原因和管理中存在的问题，完善相关管理制度和监管措施。
综上所述，农村航拍到的违建会经过一系列严谨的处理流程，包括调查核实、认定违建、作出处罚决定以及执行处罚决定等。在这个过程中，罚款是可能的处罚形式之一，但具体是否罚款以及罚款的数额会根据违建的具体情况来确定。希望这个解答能够帮助您更好地理解违建处理流程和相关法律后果。