自然资源行政不予处罚的六种情形主要包括以下内容：
违法行为轻微并及时改正，没有造成危害后果的
这一情形强调了违法行为的轻微性、及时改正以及未造成危害后果三个要素。如果违法行为轻微，且当事人在发现后立即进行了改正，同时没有给自然资源或环境造成实际损害，那么行政机关可以不予处罚。例如，某企业在未取得采矿许可证的情况下进行了少量非法采矿，但在被发现后立即停止了违法行为，并主动恢复了被破坏的地貌，且未造成严重的环境破坏或资源损失，这种情况下就可能符合不予处罚的条件。
初次违法且危害后果轻微并及时改正的
对于初次违法的当事人，如果其违法行为造成的危害后果轻微，并且在被发现后能够及时改正，行政机关也可以考虑不予处罚。这体现了行政处罚的“教育为主，惩罚为辅”原则，鼓励初次违法的当事人及时纠正错误，避免再次违法。比如，某个人首次非法占用少量土地进行建设，但在被查处后立即拆除了违法建筑，并恢复了土地原状，且未对周边环境造成明显影响，这种情况下就可能适用不予处罚。
当事人有证据足以证明没有主观过错的
如果当事人能够提供充分的证据证明自己没有主观过错，即并非故意或过失地实施了违法行为，那么行政机关可以不予处罚。这要求当事人能够证明自己的行为是出于无知、误解或其他非故意的原因，且没有造成实际危害。例如，某企业因不了解相关法律法规，误将某块土地用于了非农业用途，但在被查处后能够提供充分的证据证明自己并非故意违法，且未造成土地资源的浪费或破坏，这种情况下就可能符合不予处罚的条件。
违法行为在二年内未被发现的
根据相关法律法规的规定，如果违法行为在二年内未被行政机关发现，那么行政机关就不再给予行政处罚。这一规定体现了行政处罚的时效性原则，即行政机关必须在法定的期限内对违法行为进行查处和处罚。如果超过了这一期限，行政机关就失去了处罚的权力。但需要注意的是，这一规定并不适用于所有类型的违法行为，对于某些严重危害社会公共利益的违法行为，可能不受二年时效的限制。
依法不予行政处罚的其他情形
除了上述四种情形外，法律法规还可能规定其他不予行政处罚的情形。这些情形可能因具体的法律法规而有所不同，但通常都涉及到违法行为的性质、情节、后果以及当事人的主观状态等因素。例如，某些法律法规可能规定对于特定类型的违法行为，如果当事人能够满足一定的条件（如主动报告、配合调查等），就可以不予处罚。
涉及精神病人、智力残疾人在不能辨认或者不能控制自己行为时实施违法行为的
对于精神病人、智力残疾人在不能辨认或者不能控制自己行为时实施的违法行为，由于其缺乏辨认或控制自己行为的能力，因此行政机关可以不予处罚。但需要注意的是，这一规定并不意味着对这类人群的违法行为完全放任不管，而是要求行政机关在查明事实后，采取适当的措施（如责令其监护人严加看管和治疗等）来防止类似行为的再次发生。
在处理自然资源行政不予处罚的案件时，行政机关需要综合考虑违法行为的性质、情节、后果以及当事人的主观状态等因素，确保处罚的公正性和合理性。同时，当事人也有权对行政机关的处罚决定提出异议或申请行政复议，以维护自己的合法权益。如果你在自然资源行政处罚方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。