是的，组织他人参与黑社会活动罪确实有可能会涉及到非法持有枪械被另行起诉。以下从几个方面为你详细分析：

一、法律条款的独立性

组织、领导、参加黑社会性质组织罪与非法持有枪支罪是两个独立的罪名，它们分别由不同的法律条款进行规定。组织、领导、参加黑社会性质组织罪主要打击的是黑社会性质组织的组织、领导和参加行为，而非法持有枪支罪则是对非法持有枪支行为的直接打击。因此，如果一个人在组织他人参与黑社会活动的同时，还非法持有枪支，那么他就有可能同时触犯这两个罪名，面临数罪并罚的情况。

二、犯罪行为的关联性

在黑社会性质组织的犯罪活动中，非法持有枪支往往是一种常见的犯罪手段。黑社会性质组织为了维护其非法利益、扩大其影响力或进行其他犯罪活动，可能会非法持有枪支以增强其威慑力。因此，在组织他人参与黑社会活动的过程中，如果涉及非法持有枪支，那么这两个犯罪行为之间就存在明显的关联性。这种关联性不仅体现在犯罪目的上的一致性，还体现在犯罪手段上的相互配合。

三、司法实践中的处理

在司法实践中，对于同时触犯组织、领导、参加黑社会性质组织罪和非法持有枪支罪的犯罪嫌疑人，法院通常会根据具体情况进行数罪并罚。这意味着犯罪嫌疑人将面临更严厉的刑罚处罚。同时，如果非法持有的枪支数量较多、情节严重，或者该枪支被用于其他犯罪活动，那么犯罪嫌疑人的刑罚将会更加严厉。

四、法律建议

1. 增强法律意识：对于任何人来说，都应该增强法律意识，了解并遵守国家的法律法规。特别是对于那些可能涉及黑社会性质组织活动的人，更应该明确自己的行为边界，避免触犯法律。
2. 及时自首：如果已经涉及非法持有枪支或组织他人参与黑社会活动等犯罪行为，应该尽快向公安机关自首，争取从轻或减轻处罚。自首是法律规定的从宽处罚情节之一，对于犯罪嫌疑人来说是一个重要的机会。
3. 积极配合调查：在司法机关进行调查时，应该积极配合调查工作，如实陈述事实、提供证据。这有助于司法机关查明案件事实、准确适用法律，从而保障犯罪嫌疑人的合法权益。

如果你或你身边的人涉及此类法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。