个人申请社保相关的劳动仲裁，企业确实会受到一定影响，具体影响程度取决于仲裁结果及企业后续处理方式。以下从多个角度详细分析：

1. 法律责任层面
   若劳动仲裁裁决企业存在未依法缴纳社保等违法行为，企业需承担补缴社保、支付滞纳金甚至罚款的法律责任。根据《社会保险法》第八十六条，企业未按时足额缴纳社保费的，由社保征收机构责令限期缴纳或补足，并自欠缴之日起按日加收万分之五的滞纳金；逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。此外，若企业行为构成“未依法为劳动者缴纳社会保险费”，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并主张经济补偿金（按工作年限计算，每满一年支付一个月工资）。

2. 企业信用与声誉层面
   劳动仲裁案件信息可能被纳入企业信用记录。根据《企业信息公示暂行条例》，行政机关对企业的行政处罚信息需通过国家企业信用信息公示系统向社会公示。若企业因社保问题被裁决败诉，该信息可能影响企业参与招投标、申请政府补贴、融资贷款等经营活动，甚至降低合作伙伴或客户的信任度。

3. 内部管理层面
   劳动仲裁暴露企业社保合规漏洞后，企业需重新审视人力资源管理制度，包括社保缴纳流程、工资结构拆分（如将部分工资列为社保缴费基数）、异地参保合规性等问题。若企业存在系统性违规（如长期按最低基数缴纳社保、未为全体员工参保），可能引发更多员工效仿申请仲裁，形成连锁反应。

4. 税务风险层面
   社保缴费基数与个人所得税申报基数存在关联性。若企业通过低报社保缴费基数减少企业负担，可能同时涉及个人所得税申报不实，面临税务稽查风险。根据《税收征收管理法》，企业偷税行为可能被追缴税款、滞纳金，并处不缴或少缴税款百分之五十以上五倍以下的罚款。

建议企业采取以下措施降低风险：

• 立即自查社保缴纳情况，确保基数、比例、参保人员范围符合法律规定；
  
• 主动与劳动者协商解决争议，避免仲裁程序公开化；
  
• 完善人力资源合规体系，定期进行法律培训，避免因个别人员操作失误引发群体性纠纷；
  
• 若已收到仲裁通知，积极应诉并提交完整缴费记录、劳动合同等证据，争取通过调解或裁决减轻责任。
  

如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。