结论：在合同签订过程中，无论是盖公章还是合同章，均具备法律效力，关键在于确保印章的真实性与合法性，并遵循双方约定或特定法律法规的要求。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据与分析
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同时，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同即成立。这一条款明确了盖章行为在法律上的效力，但并未具体规定必须使用哪种类型的印章。
公章与合同章的法律地位：
- 公章：作为公司处理内外部事务的正式印鉴，广泛用于公司文件、报告等，具有广泛的法律效力，代表公司的整体意志。在合同上加盖公章，意味着公司对合同内容的确认和同意受其法律约束。
- 合同章：专用于签订合同的印章，更直接地表达了公司在合同事项上的意思表示，具有特定的证明作用。合同章的使用通常与特定的业务领域或合同类型相关联。
特殊情形的考量：
- 在某些特定行业或合同类型中，法律法规可能规定了必须使用特定印章或遵循特定盖章程序。例如，国有土地使用权出让合同等可能需要使用特定的印章或完成特定的盖章程序。
- 合同双方可通过约定明确盖章的方式和要求。此类约定一旦确立，即成为合同生效的必要条件。如果双方约定必须使用合同章，则使用公章可能不符合合同要求。
实际操作建议
首选合同章：
- 在无特定要求的情况下，使用合同章能更明确地表达双方的合同意图，减少后续可能的争议。因为合同章专用于合同签订，更能体现合同的专业性和特定性。
公章亦有效：
- 若公司仅设有公章或无特别要求，使用公章同样具有法律效力。但需确保公章的使用符合公司内部管理规定，且公章真实、合法。
验证印章真实性：
- 无论使用何种印章，都应严格核实其真实性和合法性。避免因假章或不合规盖章导致的合同纠纷。可以通过查询企业信用信息公示系统、要求对方提供印章备案证明等方式进行验证。
明确约定：
- 建议在合同中明确盖章的方式和要求，包括印章类型、盖章位置等。以减少未来可能出现的法律争议。如果双方对盖章方式有特别要求，应在合同中明确约定并遵守。
遵守特殊规定：
- 对于有特殊要求的合同或行业，务必遵循相关法律法规的规定，使用指定的印章或完成特定的盖章程序。例如，在涉及国有资产转让、土地使用权出让等特定领域时，可能需要使用特定的印章或完成特定的审批程序。
典型案例解析
在某买卖合同纠纷案中，A公司主张B公司加盖的合同章未经公安备案故合同无效。法院审理认为：B公司章程明确规定合同章由法务部统一管理，且双方此前三年持续使用该印章签订同类合同，A公司作为长期合作方对此知情。最终判决合同有效。该案例表明，印章是否备案不影响实际效力，关键在于是否符合企业真实意思表示。
综上所述，合同盖章的选择应综合考虑法律规定、双方约定及实际情况。在实际操作中，应注重细节、明确约定、遵守特殊规定，以确保合同的合法有效性及双方权益的保护。如果您在合同盖章方面遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。