结论：药店收回流药超过五万并不一定会被起诉，是否会被起诉取决于多种因素，包括回流药的性质、药店的行为是否构成犯罪、是否有自首、立功等情节，以及是否患有严重疾病等。即使患有严重疾病，也不一定能够成为免除刑事责任的理由。

分析：

1. 回流药的性质与药店行为：

   • 回流药，通常指的是从非法渠道购进或者通过其他不正当手段获取的药品，这些药品可能存在质量问题，对公众健康构成威胁。
   • 药店如果明知是回流药而仍然购进并销售，且数额超过五万，可能构成销售假药罪或者销售劣药罪等犯罪行为。
   • 是否会被起诉，首先取决于药店的行为是否构成犯罪，以及犯罪的性质和严重程度。

2. 数额与情节：

   • 数额超过五万是判断犯罪严重程度的一个重要因素，但并非唯一因素。
   • 除了数额，还会考虑药店的行为是否恶劣、是否有自首、立功等情节，以及是否对公众健康造成了实际危害等。

3. 严重疾病的影响：

   • 即使药店的经营者或者相关责任人患有严重疾病，这并不一定能够成为免除刑事责任的理由。
   • 在法律面前，人人平等，疾病不是逃避法律责任的借口。当然，在具体案件中，法院可能会考虑被告人的身体状况，在量刑时予以适当考虑，但这并不意味着可以完全免除刑事责任。

4. 法律程序与起诉决定：

   • 是否会被起诉，最终由检察机关根据案件的具体情况和法律规定来决定。
   • 检察机关会综合考虑各种因素，包括犯罪的性质、严重程度、被告人的态度、社会影响等，来作出是否起诉的决定。

建议：

• 药店应该严格遵守法律法规，不要购进和销售回流药等非法药品，以免触犯法律。
• 如果药店已经涉及此类问题，应该尽快咨询专业律师，了解自己的法律权利和义务，以及可能面临的法律后果。
• 在面对法律问题时，应该积极配合调查，如实陈述事实，争取从轻或者减轻处罚。

如果有任何关于侵权损害或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。