员工在职期间患癌症，公司的赔偿问题确实是一个复杂且需要细致考虑的情况。以下是我根据相关法律法规和实际情况，为您提供的详细解答：
一、癌症与工作无关的情况
医疗期内的待遇：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因癌症需要停止工作医疗时，会根据其工作年限给予3个月到24个月的医疗期（特殊疾病如癌症通常为24个月）。
- 在医疗期内，公司需要支付病假工资或疾病救济费，这个费用不得低于当地最低工资标准的80%。
- 同时，公司不得依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，确保员工的就业权益。
医疗期满后的处理：
- 如果员工在医疗期满后能够从事原工作或公司另行安排的工作，那么公司应继续支付正常工资待遇，让员工继续在公司工作。
- 如果员工不能从事原工作也不能从事公司另行安排的工作，公司可以提前30日以书面形式通知员工本人，或者额外支付1个月工资后解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。经济补偿金的标准是根据员工在本单位工作的年限来计算的，每满1年支付1个月工资的标准。
二、癌症被认定为职业病的情况
认定流程：
- 如果员工怀疑自己的癌症与工作有关，可以向用人单位所在地、本人户籍所在地或经常居住地的职业病诊断机构提出职业病诊断申请。
- 诊断机构会出具职业病诊断证明书，作为认定职业病的依据。
赔偿项目：
- 工伤保险待遇：如果公司依法为员工缴纳了工伤保险，员工可以享受医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、交通食宿费、辅助器具费、停工留薪期工资等工伤保险待遇。停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。如果构成伤残，还可以享受一次性伤残补助金、伤残津贴等。
- 民事赔偿责任：如果公司存在过错导致员工患职业病，除了工伤保险待遇外，公司还需要承担医疗费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等民事赔偿责任。
三、其他相关权益和注意事项
- 医疗保险报销：员工参加医保后，治疗癌症的费用可以按政策报销，包括门诊、住院、药品等费用。报销比例和限额因地区和医保类型而异。
- 企业补偿与福利：部分企业会为员工购买补充医疗保险，提高医疗费用报销比例和范围。同时，非因工负伤的员工在医疗期内也可以享受病假工资或疾病救济费。
- 劳动合同处理：在医疗期内，企业不得解除劳动合同。医疗期满后，如果员工不能从事原工作或另行安排的工作，企业可以依法解除劳动合同，但需要支付经济补偿金。
- 社会保险权益：企业应继续为员工缴纳社会保险费，确保员工享受社保待遇。
综上所述，员工在职期间患癌症的赔偿问题需要根据具体情况来分析。公司应依法承担赔偿责任，并确保员工的合法权益得到充分保障。同时，公司也应给予员工必要的关怀和支持，包括提供心理支持、协助申请相关救助等。希望这些解答能够帮助您更好地理解这个问题。