公司发最低工资但不开除，员工确实可以申请劳动仲裁。下面我详细为你解释一下这个问题：

首先，公司发放最低工资但不开除员工，这种行为可能涉及用人单位未依法足额支付劳动报酬。根据《劳动合同法》的规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准，但这并不意味着用人单位可以随意以最低工资标准支付员工工资，尤其是当员工的实际工资水平高于最低工资标准时。

其次，如果公司未经与员工协商一致就单方面降低薪资，这属于擅自变更劳动合同内容，是违法的。员工有权要求恢复原工资水平，或者通过法律途径维护自己的权益。

在这种情况下，员工可以先尝试与公司进行协商，表达自己对工资待遇的不满，并要求公司明确薪资标准、恢复合理待遇。如果协商无果，员工有权向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁。

在申请劳动仲裁时，员工需要准备相关证据，如工资条、银行流水等工资发放相关证据，以证明公司未依法足额支付劳动报酬。如果仲裁裁决支持员工的请求，公司可能需要补足工资差额，并可能面临相应的法律责任。

综上所述，公司发最低工资但不开除员工，员工有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。