结论：土地承包经营权到期后是否会被收回，需结合协议具体内容、承包合同约定及法律规定综合判断，以下分情况说明：

1. 若协议明确约定到期后自动续期或优先续约
   根据《民法典》第341条，土地经营权流转期限不得超过承包期的剩余期限。若双方在协议中明确约定“到期后自动续期X年”或“承包方享有优先续约权”，且续期期限未超过法定上限（如耕地承包期为30年，到期后可再延30年），则到期后土地不会被收回，可按约定继续承包。

2. 若协议未约定续期，但承包合同未到期
   土地承包经营权的权利来源是承包合同（如与村集体签订的《农村土地承包合同》）。若承包合同本身未到期（例如承包期30年，仅履行了10年），即使流转协议到期，原承包方仍有权继续承包至合同期满，土地不会被收回。此时流转协议到期仅影响受让方的经营权，原承包方可选择自行经营或重新流转。

3. 若协议与承包合同均到期，且无续期约定
   根据《农村土地承包法》第21条，耕地承包期届满后由集体经济组织依法延续承包（即“自动续期”），但需重新签订承包合同。若集体未调整土地分配方案，原承包方通常可继续承包；若集体决定重新发包（如因人口变动调整土地），则原承包方可能失去承包权，土地由集体收回后重新分配。

4. 特殊情形：土地被征收或用途变更
   若承包期内土地被依法征收（如修路、建厂），或因政策调整改变用途（如退耕还林），则无论协议是否到期，土地均会被收回，但承包方有权获得相应补偿（如土地补偿费、安置补助费）。

建议行动：

• 立即核查原承包合同的期限及条款，确认是否到期；
  
• 审查流转协议中关于“到期处理”的约定，重点看是否有续期、优先权等条款；
  
• 若协议即将到期且无续期约定，提前与集体经济组织沟通，了解是否延续承包；
  
• 涉及征收或用途变更的，及时主张补偿权利。
  

如有具体协议文本或合同条款需要分析，可直接向我提供细节，我会进一步结合法律条文为您解读。