当承包的村集体土地被占用时，赔偿问题主要遵循我国关于农村集体土地征收的相关规定。以下是对这一问题的详细解答：

一、赔偿归属

1. 土地补偿费：这部分费用是对土地所有权的补偿，原则上归农村集体经济组织全体成员集体所有。它旨在弥补农村集体经济组织因土地被占用而遭受的损失。

2. 安置补助费：用于安置以该承包地为主要生活来源的农业人口。如果需要进行人员安置，安置补助费应支付至承担安置责任的农村集体经济组织名下，由其进行统筹安排与管理监督。如果被征用土地的人员将得到其他单位的安置，那么安置补助费便应直接支付至负责安置工作的相关单位。如果无需通过特定单位进行统一安置，安置补助费可直接发放给被安置人员，或者经与其协商一致后，用于支付必要的保险费用。

3. 地上附着物及青苗补偿费：针对承包地上的建筑物、构筑物（如大棚、水井等）以及生长的农作物进行补偿。这部分费用归其所有权人所有，即谁拥有这些地上附着物和青苗，谁就有权获得这部分补偿。

二、补偿标准

1. 土地补偿费：一般依据该耕地被征收前三年平均年产值的一定倍数计算，具体倍数由当地规定。

2. 安置补助费：其计算通常与需要安置的农业人口数相关，人口数依据被征收的耕地数量除以征地前被征收单位平均每人占有耕地的数量确定。每一个需要安置的农业人口的安置补助费标准，也按该耕地被征收前三年平均年产值的一定倍数计算。

3. 地上附着物及青苗补偿费：补偿标准通常由各地根据实际情况制定具体细则，以确保附着物和青苗的实际价值得到合理补偿。对于树木等地上附着物，会根据其种类、数量、规格以及生长阶段等确定补偿价值。

三、补偿程序与异议处理

1. 补偿方案：需遵循法定程序制定，并保障农民的知情权、参与权和听证权等合法权益。

2. 异议处理：如果对补偿标准有异议，农民可以通过协商、申请协调或裁决等法定途径解决。在实际操作中，应确保补偿过程的公开、透明和公正。

综上所述，承包村集体土地被占用时的赔偿问题涉及多个方面，包括赔偿归属、补偿标准和补偿程序等。在处理这一问题时，应严格遵循相关法律法规和政策规定，确保各方利益得到妥善保障。