若明知对方没有相关资质仍与其合作，可能会面临以下不利影响：

1. 合同效力问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果合同内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，那么该合同可能被认定为无效。明知对方无资质而与其签订合同，很可能因违反相关法律法规（如建筑法、医疗法等对特定行业资质的要求）而导致合同无效。
   • 例子：在建设工程领域，如果明知对方没有相应的施工资质而与其签订施工合同，该合同可能因违反建筑法的强制性规定而被认定为无效。

2. 法律责任承担：

   • 如果因对方无资质而导致合同无法履行或造成损失，明知方可能需要承担相应的法律责任。这包括但不限于赔偿损失、承担违约责任等。
   • 法律背景：在合同关系中，双方都有义务确保合同的合法性和有效性。明知对方无资质而继续合作，可能被视为对合同风险的放任或接受，从而在法律上承担一定的责任。
   • 例子：在医疗合作中，如果明知对方没有行医资格而与其合作，导致患者受损，明知方可能需要与无资质方共同承担赔偿责任。

3. 行政处罚风险：

   • 除了民事责任外，明知方还可能面临行政处罚。相关监管部门可能对明知方进行罚款、吊销许可证等行政处罚，特别是当合作涉及公共安全、健康等关键领域时。
   • 法律背景：为了维护市场秩序和公共利益，法律法规对特定行业的资质有严格要求。明知方违反这些规定，将受到相应的行政处罚。
   • 例子：在食品安全领域，如果明知对方没有食品生产许可证而与其合作生产食品，明知方可能面临食品药品监管部门的严厉处罚。

4. 声誉损害：

   • 明知对方无资质而与其合作，还可能对明知方的声誉造成损害。这种损害可能影响明知方的商业信誉、客户信任度等，进而对其长期发展产生不利影响。
   • 法律建议：在商业合作中，应严格审查对方的资质和信誉，确保合作的合法性和安全性。避免因追求短期利益而忽视长期风险。

针对此情况，我给出以下法律建议：

• 在合作前，务必对对方的资质进行全面审查，确保其具备从事相关业务的合法资格。
• 如果发现对方无资质或资质不符，应立即终止合作，并寻求其他合法合规的合作伙伴。
• 如果已经与无资质方合作并面临法律风险，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，并采取相应的法律措施来降低风险。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。