结论前置：公司法人不是股东的情况下，股东会决议一般不能直接免去法人职务，但可以通过特定程序实现法人的变更。
详细分析：
法人职务的性质与变更程序：
- 法人职务，即公司法定代表人的职务，是由公司章程规定并由公司内部机构（如董事会或股东会）选举或聘任产生的。法定代表人代表公司对外行使职权，其职务的变更通常需要遵循公司章程和公司法的相关规定。
- 在大多数情况下，公司法人的变更并非由股东会直接决议免除，而是需要通过修改公司章程或按照公司章程规定的程序进行。如果公司章程中明确规定了法定代表人的选举、聘任或解聘程序，那么应当遵循这些程序进行。
股东会决议的作用与限制：
- 股东会是公司的权力机构，有权决定公司的重大事项。然而，股东会的决议通常受到公司章程和公司法的限制。在变更法定代表人方面，股东会可以提出变更的建议或决策，但具体的变更程序（如修改公司章程、选举新法定代表人等）可能需要其他公司机构（如董事会）的配合或执行。
- 如果公司章程没有明确规定法定代表人的变更程序，或者股东会决议与章程规定相冲突，那么股东会决议可能无法直接导致法定代表人的变更。在这种情况下，可能需要通过法律途径（如诉讼）来解决争议。
实际操作中的建议：
- 查阅公司章程：首先，应查阅公司章程中关于法定代表人选举、聘任或解聘的规定，以确定具体的变更程序。
- 遵循法定程序：根据章程规定，按照法定程序进行法定代表人的变更。这可能包括召开股东会、修改公司章程、选举新法定代表人等步骤。
- 确保决议合法有效：股东会决议应当符合公司法和公司章程的规定，确保决议的合法性和有效性。如果决议存在瑕疵或违法情况，可能导致变更无效或引发法律纠纷。
- 办理工商变更登记：在完成内部变更程序后，还需要及时到工商行政管理部门办理法定代表人的变更登记手续，以确保公司对外公示信息的准确性。
法律后果与风险提示：
- 如果股东会决议未经法定程序或违反公司章程规定而试图变更法定代表人，可能导致决议无效或被撤销。
- 法定代表人变更后，公司应及时更新相关证照、合同等文件中的法定代表人信息，以避免因信息不一致而引发的法律风险。
进一步思考：
- 在实际操作中，公司应重视公司章程的制定和修改工作，确保章程内容合法、合规且具有可操作性。
- 股东会、董事会等公司机构应明确各自的职责和权限，避免在法定代表人变更等重大事项上出现决策混乱或程序瑕疵。
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