结论：执行款和起诉费一般不可以与法院协商，且起诉费通常不会从执行款中扣除，但具体情形需结合案件实际情况和法律规定来分析。

分析说明：

1. 执行款与法院协商问题：

   • 执行款是法院根据生效法律文书（如判决书、裁定书等）确定的，由被执行人支付给申请执行人的款项。这一款项的数额和支付方式均由法律文书明确规定，法院在执行过程中需严格依照法律文书的内容进行，一般不允许与当事人协商变更。
   • 如果在执行过程中出现特殊情况，如被执行人确实无力一次性支付全部执行款，法院可能会根据实际情况，在符合法律规定的前提下，组织双方当事人进行和解或调解，以达成分期支付等执行方案。但这并非与法院的“协商”，而是双方当事人之间的和解或调解，且需法院审查认可后方可实施。

2. 起诉费与执行款关系问题：

   • 起诉费是当事人向法院提起诉讼时，根据诉讼标的额和案件类型等标准缴纳的费用。这一费用由提起诉讼的当事人承担，与执行款无直接关联。
   • 在执行过程中，起诉费通常不会从执行款中扣除。执行款是专门用于履行生效法律文书确定的义务，如支付赔偿金、返还财产等。起诉费作为诉讼过程中的一项费用，应由当事人另行承担。
   • 当然，如果当事人在诉讼过程中达成调解协议或和解协议，且协议中明确约定了起诉费的承担方式，那么法院在执行过程中可能会根据协议内容来处理起诉费的承担问题。但这属于当事人之间的约定，并非法院的强制执行行为。

特殊情形：

• 在某些特殊情况下，如被执行人确实无力支付执行款和起诉费，且申请执行人同意放弃部分或全部起诉费，法院可能会根据实际情况进行调解或裁决，但这需要双方当事人的同意和法院的审查认可。

行动建议：

• 如果您对执行款或起诉费有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况和法律规定，为您提供全面、准确的法律意见和解决方案。