对于运输企业两类人员未持证的情况，处罚措施主要依据相关法律法规进行，具体如下：

1. “两类人员”的定义与持证要求：

   • 在交通运输领域，“两类人员”通常指的是企业的主要负责人和安全生产管理人员。根据《中华人民共和国安全生产法》及相关交通运输行业规定，这些人员需要接受专门的安全生产培训，并通过考核取得相应的安全合格证书，方可任职。

2. 未持证的处罚依据：

   • 若运输企业的主要负责人或安全生产管理人员未按照规定取得安全合格证书，即属于违法行为。根据《中华人民共和国安全生产法》第九十七条：“生产经营单位有下列行为之一的，责令限期改正，处十万元以下的罚款；逾期未改正的，，责令停产停业整顿，并处十万元以上二十万元以下的罚款，对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处二万元以上五万元以下的罚款：……（七）特种作业人员未按照规定经专门的安全作业培训并取得相应资格，上岗作业的。”虽然该条款直接提及的是特种作业人员，但“两类人员”作为安全生产的关键岗位，其未持证上岗同样可能面临类似的处罚，具体依据地方性法规或行业规定可能有所细化。
   • 此外，交通运输行业可能还有特定的法规或规章，对“两类人员”的持证要求及未持证的处罚作出更详细的规定。例如，某些地区或行业可能规定，未持证上岗的“两类人员”将面临警告、罚款、责令改正等行政处罚，情节严重的还可能影响企业的运营资质或安全生产标准化评级。

3. 具体处罚措施：

   • 责令限期改正：交通运输管理部门在发现“两类人员”未持证上岗时，通常会首先责令企业限期改正，即要求企业在规定时间内安排相关人员参加培训并取得合格证书。
   • 罚款：若企业未在规定期限内改正，交通运输管理部门将对企业处以罚款。罚款的数额根据违法行为的严重程度、企业的规模、是否造成危害后果等因素综合确定，但通常不会超过法定上限。
   • 其他处罚：在情节严重的情况下，交通运输管理部门还可能采取责令停产停业整顿、吊销相关证照等更严厉的处罚措施。这些措施将直接影响企业的正常运营和经济效益。

4. 建议与预防措施：

   • 加强培训与管理：运输企业应加强对“两类人员”的安全生产培训和管理，确保他们具备必要的安全生产知识和管理能力，并按时参加复审和换证工作。
   • 建立持证上岗制度：企业应建立严格的持证上岗制度，明确“两类人员”的任职条件和资格要求，杜绝无证上岗现象的发生。
   • 定期自查与整改：企业应定期对“两类人员”的持证情况进行自查，发现问题及时整改，避免因未持证上岗而引发的法律风险和安全隐患。

总结来说，运输企业“两类人员”未持证上岗将面临责令限期改正、罚款等行政处罚，情节严重的还可能影响企业的运营资质。因此，企业应高度重视“两类人员”的持证问题，加强培训与管理，确保安全生产工作的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。