军队转业干部在地方受到刑事处罚后，其在部队的公寓房处理，通常需依据具体情况和军队的相关规定来确定。以下是一些可能的情况及处理方式：

1. 公寓房使用权被收回：

   • 军队转业干部在受到刑事处罚后，如果其公寓房的使用权与军队有明确的约定，且约定中包含了因违法犯罪行为导致使用权被收回的条款，那么军队有权根据约定收回公寓房的使用权。
   • 即使没有明确的约定，但军队根据相关规定或政策，也可能决定收回公寓房的使用权，特别是在干部的行为严重损害了军队形象或利益的情况下。

2. 公寓房使用权不受影响：

   • 如果军队转业干部在受刑事处罚前，已经通过合法途径获得了公寓房的长期使用权或所有权，并且该权益未受到法律或军队规定的限制，那么其公寓房的使用权可能不会因刑事处罚而受到影响。
   • 在这种情况下，干部可以继续使用公寓房，但需遵守相关的管理规定和法律法规。

3. 特殊情况的特殊处理：

   • 对于某些特殊情况，如军队转业干部因执行公务而受刑事处罚，或者其刑事处罚与公寓房的使用无直接关联等，军队可能会根据具体情况作出特殊处理决定。
   • 这些特殊情况需要由军队相关部门进行具体分析和判断，并依据相关规定和政策作出处理决定。

综上所述，军队转业干部在地方受到刑事处罚后，其在部队的公寓房处理需依据具体情况和军队的相关规定来确定。建议干部或其家属及时与军队相关部门联系，了解具体的处理政策和程序，以便做出相应的安排。