若夫妻双方已经分居多年，并希望通过诉讼方式来离婚，那么需要遵循一系列的法定程序。以下是一个详细且清晰的解答，希望能帮助您更好地理解和操作：

一、确定管辖法院

首先，需要确定哪个法院有管辖权来审理您的离婚案件。

• 一般情况：离婚诉讼通常由被告住所地（即户籍所在地）的人民法院管辖。如果被告的住所地与经常居住地不一致，那么由经常居住地（即被告离开住所地至起诉时已连续居住一年以上的地方，但住院就医的地方除外）的人民法院管辖。

• 特殊情况：如果被告不在中华人民共和国领域内居住、下落不明或宣告失踪、被采取强制性教育措施、被监禁等，那么由原告住所地或经常居住地的人民法院管辖。

二、准备诉讼材料

接下来，需要准备一系列的诉讼材料来支持您的离婚诉求。

1. 起诉状：

   • 明确列出原告和被告的基本信息，包括姓名、性别、年龄、民族、职业、工作单位、住所和联系方式。
   • 清晰阐述您的诉讼请求，包括请求判决离婚、子女抚养、财产分割和债务承担等。
   • 详细陈述分居的时间、原因以及夫妻感情破裂的具体情况。

2. 证据材料：

   • 身份证据：提供双方身份证复印件和户口簿复印件。
   • 婚姻关系证据：提供结婚证原件及复印件，或者婚姻登记机关开具的婚姻关系证明。
   • 分居证据：这是关键证据，需要证明分居的事实和时间。可以提供分居协议、租房合同、居委会或物业开具的居住证明、聊天记录、证人证言等。
   • 子女相关证据：如果涉及子女抚养问题，需要提供子女的出生证明、户口簿以及证明自己抚养更有利的证据。
   • 财产证据：梳理夫妻共同财产，并提供相关财产凭证，如房产证、车辆行驶证、银行存款证明等。
   • 其他证据：如果一方有过错，如重婚、家暴等，需要收集相关证据，如报警记录、医院诊断证明、证人证言等。

3. 其他材料：

   • 准备原告身份证原件及复印件，以及提交材料的一式多份（根据被告人数确定，并额外准备一份给法院留存）。

三、提起诉讼与参加庭审

1. 提起诉讼：

   • 将准备好的起诉状和证据材料提交到有管辖权的法院立案庭。
   • 法院会对材料进行审查，如果符合立案条件，会予以受理，并通知原告缴纳诉讼费用。离婚案件的诉讼费用根据具体情况而定，一般在50元至300元之间，如果涉及财产分割，还需要按规定交纳额外的费用。

2. 参加庭审：

   • 庭前准备：在庭审前，需要整理好证据，收集辩论观点，并可以考虑委托律师代理诉讼。
   • 庭审过程：
     • 法庭调查：双方当事人会陈述案件事实，并进行举证和质证。
     • 法庭辩论：围绕争议焦点，如夫妻感情是否破裂、子女抚养、财产分割等问题，进行辩论和阐述观点。
     • 最后陈述：在庭审的最后阶段，双方当事人会简要陈述自己的最后意见。
   • 庭审调解：法院会组织双方进行调解，如果达成调解协议，会制作调解书，具有法律效力。

四、等待判决与后续处理

1. 等待判决：

   • 法院会根据庭审情况和相关证据进行判决。如果认定夫妻感情确已破裂且调解无效，一般会判决准予离婚。特别是如果分居满二年且调解无效的情况下，法院通常会准予离婚。

2. 后续处理：

   • 如果对一审判决不服，可以在判决书送达之日起十五日内向上一级人民法院提起上诉。
   • 判决生效后，需要按照判决内容履行相应义务，如办理离婚手续、分割财产等。

五、其他注意事项

• 整个离婚诉讼的时间因案件复杂程度而异。简易程序一般在三个月内审结，普通程序一般在六个月内审结，特殊情况可以延长。
• 考虑到离婚诉讼的复杂性和专业性，建议寻求专业律师的帮助以确保权益得到充分保护。律师可以提供法律咨询、帮助准备证据材料、指导如何起诉，并共同努力争取最有利的结果。

希望以上解答能够帮助您更好地理解和操作分居多年后的离婚诉讼程序。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询专业律师或相关机构。