合作协议中保本条款的法律效力需分情况讨论，具体如下：

1. 保本条款合法有效的情况

   • 内容合法合规：若保本条款的内容不违反国家法律法规的强制性规定，不损害社会公共利益或违背公序良俗，且双方意思表示真实，该条款通常具有法律效力。例如，双方约定在合作期间，若因市场原因导致亏损，一方承诺以自有资金补偿另一方的损失，且该补偿方式不涉及非法集资、金融诈骗等违法行为，则该保本条款有效。
   • 形式要求满足：虽然保本条款作为合作协议的一部分，其形式要求通常与合作协议整体一致，但书面形式更有利于明确双方权利义务，减少纠纷。若保本条款以书面形式明确记载于合作协议中，且双方签字盖章确认，则其法律效力更易得到认可。

2. 保本条款可能无效的情况

   • 违反法律法规强制性规定：若保本条款涉及非法集资、金融诈骗、保底收益等违反法律法规强制性规定的内容，则该条款无效。例如，双方约定一方承诺向另一方支付固定收益，无论合作项目是否盈利，均需按约定支付，这种“保底收益”条款可能因违反金融监管规定而被认定为无效。
   • 损害社会公共利益或违背公序良俗：若保本条款的内容损害社会公共利益或违背公序良俗，如约定通过不正当手段获取利益以保本，则该条款无效。
   • 意思表示不真实：若双方在签订合作协议时，存在欺诈、胁迫、重大误解等不正当手段，导致保本条款的意思表示不真实，则受欺骗方有权请求撤销该条款。

法律建议：

• 审慎约定保本条款：在签订合作协议时，双方应审慎考虑保本条款的合法性和合理性，避免约定违反法律法规强制性规定或损害社会公共利益的内容。
• 明确条款内容：保本条款应明确约定补偿方式、补偿条件、补偿期限等关键内容，避免模糊不清导致纠纷。
• 采取书面形式：为确保保本条款的法律效力，建议双方采取书面形式签订合作协议，并明确记载保本条款的内容。
• 咨询专业律师：在签订涉及保本条款的合作协议前，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性，并降低法律风险。不过，你既然已经向我咨询了，就可以直接把具体情况告诉我，我会为你提供专业的法律意见。

可能法律后果：

• 若保本条款合法有效，则双方应按照约定履行义务，一方违约时，另一方有权要求违约方承担违约责任。
• 若保本条款无效，则双方应按照法律法规的规定或合作协议的其他约定处理纠纷，可能无法获得预期的保本效果。