结论概述：穗深城际全线通车后，乘客与运营方的权利义务界定主要依据《中华人民共和国民法典》中关于运输合同的相关规定，以及铁路运输领域的特定法规。结合新闻背景，穗深城际的通车将极大提升大湾区城际铁路网的通达性，乘客与运营方之间的权利义务关系也将更加明确和复杂。以下从多个维度进行详细分析。

一、乘客的权利与义务

1. 权利：

   • 安全运输权：乘客有权要求运营方提供安全、准时的运输服务。根据《民法典》第八百一十九条，承运人应当按照约定的或者通常的运输路线将旅客运输到约定地点。
   • 知情权：乘客有权了解运输服务的详细信息，包括车次、时间、票价、站点等。运营方应通过官方网站、售票窗口等渠道及时、准确发布相关信息。
   • 索赔权：若因运营方原因导致乘客人身伤害或财产损失，乘客有权依据《民法典》第八百二十三条要求运营方承担赔偿责任。

2. 义务：

   • 支付票款义务：乘客应按照规定支付票款，这是运输合同成立的基本条件。
   • 遵守乘车规则义务：乘客应遵守运营方制定的乘车规则，如不得携带危险品上车、不得在车厢内吸烟等。
   • 配合安检义务：乘客应配合运营方进行安全检查，确保运输安全。

二、运营方的权利与义务

1. 权利：

   • 收取票款权：运营方有权按照规定收取票款，这是其提供运输服务的主要经济来源。
   • 制定乘车规则权：运营方有权制定乘车规则，以维护运输秩序和乘客安全。
   • 拒绝运输权：对于违反乘车规则或存在安全隐患的乘客，运营方有权拒绝其乘车。

2. 义务：

   • 安全运输义务：运营方应确保运输过程中的安全，包括车辆安全、线路安全、人员安全等。根据《民法典》第八百二十一条，承运人应当严格履行安全运输义务，及时告知旅客安全运输应当注意的事项。
   • 提供必要服务义务：运营方应提供必要的服务设施，如座椅、卫生间、饮水机等，以满足乘客的基本需求。
   • 信息披露义务：运营方应及时、准确披露运输服务的相关信息，包括车次变更、延误通知等。

三、结合新闻背景的特别分析

1. 通车后的影响：穗深城际的通车将极大提升大湾区城际铁路网的通达性，乘客可以更加便捷地往返于深圳、广州等城市之间。这将导致乘客数量增加，运营方需要承担更大的运输责任和安全保障义务。

2. 运营权移交的影响：根据新闻背景，穗深城际的运营权已由广铁集团移交至广州地铁集团旗下的广东城际公司。这一变更可能导致运营方的管理方式和服务标准发生变化，但乘客与运营方之间的基本权利义务关系不变。运营方应确保在移交过程中运输服务的连续性和安全性。

3. 安全预评估的重要性：新闻背景中提到，广东城际铁路运营有限公司已发布安全预评估咨询服务项目公开比选公告。这表明运营方高度重视运输安全，通过提前进行安全预评估来识别潜在风险并采取措施加以防范。这有助于保障乘客的安全运输权，并减少因安全事故引发的法律纠纷。

四、法律建议与风险提示

1. 乘客方面：建议乘客在乘车前仔细阅读乘车规则，了解自己的权利和义务。在乘车过程中，应遵守相关规定，配合运营方的工作。若遇到权益受损的情况，应及时保留证据并依法维权。

2. 运营方方面：建议运营方加强安全管理，完善服务设施，提高服务质量。同时，应建立健全的投诉处理机制，及时回应乘客的诉求和关切。在运营过程中，应严格遵守相关法律法规和行业标准，避免因违法行为引发法律纠纷。

总结：穗深城际全线通车后，乘客与运营方之间的权利义务关系将更加明确和复杂。双方应依法履行各自的权利和义务，共同维护运输秩序和乘客安全。若遇到法律问题或纠纷，可直接向我咨询以获取专业法律意见。