关于合作协议是否需要盖骑缝章的问题，这并非是一个绝对的、普遍适用的规则，而是取决于具体的合作场景、协议内容以及双方或多方的约定。不过，我可以从一般情况和特定场景两个角度来为您详细解答。

一般情况：

在大多数合作场景中，合作协议并不强制要求盖骑缝章。合作协议的核心在于其内容，即双方或多方约定的权利、义务和责任。只要协议内容清晰、明确，且各方均已签字或盖章确认，那么这份协议就具有法律效力。骑缝章虽然可以作为一种额外的防伪措施，但并不是协议生效的必要条件。

特定场景：

然而，在某些特定场景下，盖骑缝章可能会被视为一种必要的或推荐的做法。例如：

1. 涉及重要商业秘密或敏感信息的协议：为了防止协议内容被篡改或替换，各方可能会选择在协议的每一页都盖上骑缝章，以确保协议的完整性和真实性。

2. 需要多份副本的协议：如果协议需要制作多份副本，且各方需要分别保存，那么盖骑缝章可以作为一种有效的防伪手段，防止副本被替换或篡改。

3. 特定行业或地区的惯例：在某些特定行业或地区，盖骑缝章可能被视为一种行业惯例或地方规定，因此各方在签订协议时可能会遵循这一做法。

结合您提供的参考信息：

在您提供的《2022年度深圳市科技型中小微企业贷款贴息贴保项目合作银行申请指南》中，确实提到了在提交申请材料时，对于2页以上的材料需要加盖骑缝章。但这主要是针对申请材料的提交要求，而非合作协议本身的签订要求。因此，这一要求并不能直接推广到所有合作协议的签订上。

总结与建议：

综上所述，合作协议是否需要盖骑缝章并没有一个固定的答案。它取决于具体的合作场景、协议内容以及双方或多方的约定。如果您在签订合作协议时对此有疑问，建议您与对方或多方进行沟通协商，明确各自的需求和期望，以达成一个双方都能接受的协议签订方式。同时，无论是否盖骑缝章，都请确保协议内容的清晰、明确和合法性，以保障各方的权益。