滞纳金应由规章设定的依据主要来源于法律法规的明确规定，以下从不同角度为你详细分析：
法律法规的直接规定：
- 在许多法律法规中，都明确规定了滞纳金的设定。例如，《中华人民共和国税收征收管理法》第三十二条规定，纳税人未按照规定期限缴纳税款的，扣缴义务人未按照规定期限解缴税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。这是税收领域滞纳金设定的直接法律依据。
- 类似地，其他法律法规如《中华人民共和国道路交通安全法》、《中华人民共和国社会保险法》等，也分别在其领域内规定了滞纳金的设定条件和标准。
规章的设定权限与依据：
- 规章，包括部门规章和地方政府规章，其设定滞纳金的权限来源于法律法规的授权。当法律法规明确授权某部门或地方政府可以制定规章来设定滞纳金时，该部门或地方政府就有权在其制定的规章中规定滞纳金的设定条件和标准。
- 例如，某地方政府根据《中华人民共和国社会保险法》的授权，制定了关于社会保险费征收的地方政府规章，其中就可能包括滞纳金的设定条款。
滞纳金设定的合法性原则：
- 无论是法律法规还是规章，在设定滞纳金时都必须遵循合法性原则。这意味着滞纳金的设定必须有明确的法律依据，且设定的条件和标准必须合理、公正，不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果规章设定的滞纳金违反了法律法规的规定，或者设定的条件和标准不合理、不公正，那么该滞纳金条款就可能被认定为无效。
滞纳金与违约金的区别：
- 在探讨滞纳金设定依据时，还需要注意滞纳金与违约金的区别。滞纳金通常是由法律法规或规章设定的，具有行政处罚或强制执行的性质；而违约金则是由合同双方约定的，用于弥补因违约造成的损失。
- 因此，在合同纠纷中，如果涉及滞纳金的争议，需要首先明确该滞纳金是由法律法规、规章设定的，还是由合同双方约定的违约金。
针对你的情况，我给出以下建议：
- 如果你对某项滞纳金的设定有疑问，首先应当查阅相关的法律法规或规章，确认该滞纳金的设定是否有明确的法律依据。
- 如果发现规章设定的滞纳金违反了法律法规的规定，或者设定的条件和标准不合理、不公正，你可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。
- 在签订合同时，如果涉及滞纳金的约定，应当仔细阅读合同条款，确保该约定符合法律法规的规定，并明确滞纳金的计算方式和支付条件。
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