农民工发生工伤后，主要由人力资源和社会保障部门（人社局）负责相关事务的处理，同时涉及劳动能力鉴定委员会、社会保险经办机构、劳动争议仲裁机构及人民法院等多个部门。以下是详细说明：
一、人力资源和社会保障部门（人社局）
工伤认定：
- 农民工发生工伤后，首先需向用人单位所在地或事故发生地的人社局申请工伤认定。这是获得工伤赔偿的前提。
- 申请工伤认定时，需提交工伤认定申请表、劳动关系证明、医疗诊断证明等相关材料。
- 人社局将在规定时间内对申请进行审核与调查，并作出是否认定为工伤的决定。
监督管理：
- 人社局还负责监督用人单位遵守劳动保障法规，确保工伤保险制度的正常运行，保障工伤职工的合法权益。
二、劳动能力鉴定委员会
- 经认定为工伤后，若伤情影响劳动能力，农民工需向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定。
- 劳动能力鉴定委员会将依据相关标准对工伤职工的劳动功能障碍程度和生活自理障碍程度作出等级鉴定，这是计算赔偿金额的重要依据。
三、社会保险经办机构
- 若用人单位已为农民工缴纳工伤保险费，社会保险经办机构将负责工伤保险待遇的支付，如一次性伤残补助金、伤残津贴等。
- 农民工需按照规定的流程向社会保险经办机构申请领取工伤保险待遇。
四、劳动争议仲裁机构
- 若用人单位未依法缴纳工伤保险费，导致农民工无法从工伤保险基金获得赔偿，农民工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁委员会将依法审理并作出裁决，要求用人单位支付工伤保险待遇。
五、人民法院
- 对仲裁裁决不服的，农民工可向人民法院提起诉讼。
- 人民法院将依法审理并判决，确保农民工的合法权益得到保障。
农民工工伤赔偿的具体流程与注意事项
及时申请工伤认定：
- 自事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。
- 确保提交的材料真实、完整，以便顺利通过审核。
配合劳动能力鉴定：
- 根据鉴定结果确定伤残等级，作为计算赔偿金额的依据。
- 积极参与鉴定过程，提供必要的医疗资料和证据。
了解赔偿项目与标准：
- 包括医疗费、停工留薪期工资、护理费、一次性伤残补助金、伤残津贴等。
- 具体标准由《工伤保险条例》及地方规定确定，需仔细了解并核对。
维护自身权益：
- 若用人单位未依法参保或拒绝支付赔偿，农民工有权要求其承担全部赔偿责任。
- 在协商无果时，可通过仲裁或诉讼途径解决争议，确保自身权益不受侵害。
举例说明：假设农民工小李在工地受伤，他首先应向用人单位所在地的人社局申请工伤认定。经认定为工伤后，若伤情影响劳动能力，他需向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定。若用人单位已为其缴纳工伤保险费，社会保险经办机构将负责支付工伤保险待遇。若用人单位未依法缴纳工伤保险费，小李可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付工伤保险待遇。对仲裁裁决不服的，他还可向人民法院提起诉讼。
特别提醒：农民工在工伤发生后，应迅速采取行动，从医疗救治到法律维权，每一步都至关重要。通过了解并遵循上述法律知识和流程，农民工可以更有效地保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。