针对您提出的“车辆违法营运如何起诉”的问题，这实际上涉及的是对非法营运行为的法律追责流程，而非传统意义上的民事起诉。不过，我可以为您详细解释如何对非法营运行为进行法律追责，这通常包括行政处罚和可能的刑事处罚两个层面。
一、行政处罚流程
调查取证：
- 交通运输管理部门在发现或接到举报非法营运行为后，会启动调查程序。
- 调查方式包括现场检查、询问乘客和司机、收集相关证据（如交易记录、乘客证言等）。
扣押车辆：
- 如有初步证据证明车辆存在非法营运行为，交通运输管理部门有权依法扣押涉案车辆，以防止违法行为继续，并保障后续处理程序的顺利进行。
作出处罚决定：
- 根据调查结果，交通运输管理部门会依据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规，对非法营运行为作出处罚决定。
- 处罚通常包括罚款、没收违法所得，并可能责令停业整顿或吊销相关营运证件。
执行处罚：
- 车主或驾驶员需在规定时间内前往指定交通执法部门接受处理，缴纳罚款及相关费用，并办理车辆取回手续（如车辆被扣押）。
二、刑事处罚流程（如构成非法经营罪）
刑事立案：
- 若非法营运行为严重扰乱市场秩序，情节严重，交通运输管理部门或公安机关可能会将其作为刑事案件立案侦查。
侦查与起诉：
- 公安机关会进行进一步的侦查，收集证据，查明事实。
- 侦查终结后，公安机关会将案件移送检察机关审查起诉。
审判与判决：
- 检察机关向法院提起公诉后，法院会依法进行审理，并根据事实和法律规定作出判决。
- 若构成非法经营罪，车主或驾驶员可能面临有期徒刑、拘役、罚金或没收财产等刑事处罚。
三、车辆所有人的应对措施
配合调查：
- 如车辆被认定为非法营运，车主或驾驶员应积极配合交通运输管理部门或公安机关的调查工作。
陈述和申辩：
- 在接受处理过程中，车主或驾驶员有权进行陈述和申辩，提供相关证据和理由以证明自己的清白或减轻处罚。
寻求法律帮助：
- 如对处罚决定或刑事指控有异议，车主或驾驶员可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。
四、注意事项
- 保留证据：在涉及非法营运的争议中，保留相关证据（如交易记录、乘客证言、车辆行驶记录等）至关重要。
- 遵守法律：强烈建议所有车主和驾驶员严格遵守相关法律法规，避免从事非法营运活动，以免面临严厉的法律制裁。
综上所述，对车辆违法营运行为的法律追责主要涉及行政处罚和可能的刑事处罚两个层面。车主或驾驶员应积极配合调查工作，并在必要时寻求法律帮助以维护自己的合法权益。同时，遵守法律法规是预防此类问题的最佳途径。