行政村变为自然村，若百姓不同意，这一反对行为本身并不直接决定变更的合法性或有效性，但百姓的反对意见在行政决策过程中具有重要影响，且可能引发法律程序上的审查。以下从不同角度进行详细分析：

1. 行政决策的合法性基础：

   • 行政村变为自然村，通常涉及行政区划的调整或村庄合并等行政决策。这类决策需遵循法定程序，包括但不限于调研论证、征求意见、公告公示等环节。
   • 百姓的反对意见，作为公众参与行政决策的重要体现，行政机关在决策过程中应当予以充分考虑。若行政机关未依法履行征求意见等程序，或未对百姓的反对意见进行合理回应，则可能影响决策的合法性。

2. 百姓反对意见的法律效力：

   • 百姓的反对意见本身并不具有直接阻止行政村变为自然村的法律效力。然而，它可以通过法律途径（如行政复议、行政诉讼等）对行政决策的合法性提出挑战。
   • 若百姓认为行政决策侵犯了其合法权益（如土地权益、居住权益等），可以依法向行政机关提出复议申请，或向人民法院提起行政诉讼，请求撤销或变更该行政决策。

3. 行政决策的审查与救济：

   • 在行政复议或行政诉讼过程中，法院或复议机关将对行政决策的合法性进行审查，包括是否依法履行了征求意见等程序、是否对百姓的反对意见进行了合理回应等。
   • 若行政决策被认定存在违法情形，法院或复议机关将依法作出撤销、变更或确认违法的判决或决定，从而保障百姓的合法权益。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于百姓而言，若对行政村变为自然村的决策持有反对意见，应积极参与行政决策过程，通过合法途径表达诉求，如参加听证会、提交书面意见等。
   • 若行政决策已经作出且百姓认为其侵犯了自身权益，应及时咨询专业律师，了解自身权利救济途径，并依法提起行政复议或行政诉讼。

总结来说，行政村变为自然村的过程中，百姓的反对意见虽不直接决定变更的合法性或有效性，但行政机关应依法履行征求意见等程序，并对百姓的反对意见进行合理回应。若百姓认为行政决策侵犯了其合法权益，可依法通过行政复议或行政诉讼等途径寻求救济。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。