结论：本诉答辩的证据与反诉的证据部分重叠时，不需要分开独立提交，但建议根据证据的具体用途和证明目的进行分类整理，并在提交时明确标注。

分析说明：

1. 证据提交的基本原则：

   • 在诉讼过程中，无论是本诉还是反诉，证据的提交都应当遵循真实、合法、关联的原则。证据的提交是为了支持自己的主张或反驳对方的主张，因此，证据的整理和提交应当围绕这一核心目的进行。

2. 重叠证据的处理：

   • 当本诉答辩的证据与反诉的证据部分重叠时，这意味着这些证据可能同时对本诉和反诉的某个或某些事实具有证明作用。在这种情况下，不需要将这些重叠的证据分开独立提交，因为这样做既浪费资源，也可能导致证据之间的逻辑关系变得混乱。
   • 然而，为了避免混淆和便于法庭审查，建议在提交证据时，根据证据的具体用途和证明目的进行分类整理。例如，可以将证明同一事实的证据放在一起，并在证据清单中明确标注这些证据同时用于本诉答辩和反诉。

3. 证据提交的实践建议：

   • 在准备证据时，可以制作一份详细的证据清单，清单中应包括证据的名称、来源、证明目的以及是否同时用于本诉和反诉等信息。
   • 在提交证据时，可以附上一份简要的说明，解释证据之间的逻辑关系以及它们如何支持自己的主张或反驳对方的主张。
   • 如果重叠的证据较多或较为复杂，可以考虑在提交前与法庭或对方进行沟通，以确保证据的提交和审查能够顺利进行。

特殊情况说明：

• 如果重叠的证据中存在部分证据仅对本诉或反诉中的某一个具有特定证明作用，而其他证据则对两者均有证明作用，那么在这种情况下，可以将仅具有特定证明作用的证据单独列出，并在证据清单中明确标注其用途。

后续行动建议：

• 在准备和提交证据时，务必保持谨慎和细致，确保所有证据的真实性和合法性。
• 如果对证据的提交和整理存在疑问或困惑，可以随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步的法律建议和指导。