酒驾行为若在三个月后才被发现，仍可能面临行政处罚，若构成危险驾驶罪则需承担刑事责任，具体处理方式需结合实际情况判断。以下分情况详细说明：

一、若酒驾行为未达到刑事立案标准（一般酒驾）

1. 行政处罚的法律依据
   根据《道路交通安全法》第九十一条，饮酒后驾驶机动车的，处暂扣六个月机动车驾驶证，并处一千元以上二千元以下罚款。行政处罚的追责时效为两年，即使三个月后才发现，公安机关仍可依法处罚。

2. 处罚流程

   • 公安机关会通过调取监控、证人证言、酒精检测记录等证据固定违法事实；
     
   • 通知当事人接受处理，若当事人拒不配合，可能面临强制传唤或公告送达处罚决定；
     
   • 处罚决定生效后，当事人需在规定期限内缴纳罚款、参加满分学习并考试合格后才能取回驾驶证。

3. 特殊情形
   若当事人逃避处罚（如拒不配合调查、隐匿身份），公安机关可申请法院强制执行罚款，并可能将违法行为录入征信系统，影响个人信用。

二、若酒驾行为达到刑事立案标准（醉驾或情节恶劣）

1. 刑事责任的认定
   根据《刑法》第一百三十三条之一，醉酒驾驶机动车（血液酒精含量≥80mg/100ml）或追逐竞驶、严重超载等情节恶劣的，构成危险驾驶罪，处拘役（1-6个月）并处罚金。刑事追诉时效为五年，三个月后发现仍可追责。

2. 刑事立案流程

   • 公安机关会立案侦查，收集血液酒精检测报告、行车记录、证人证言等证据；
     
   • 移送检察院审查起诉，检察院认为证据充分的会向法院提起公诉；
     
   • 法院审理后，若认定构成犯罪，会判处拘役并处罚金，同时吊销驾驶证且五年内不得重新取得。

3. 从宽处理情形
   若当事人主动投案、如实供述、认罪认罚，或醉酒程度较低、无其他恶劣情节，可能被免予起诉或判处缓刑，但需接受社区矫正。

三、实务中的关键点

1. 证据固定
   即使行为发生三个月后，公安机关仍可通过调取事发时的监控、行车记录仪、证人证言等证据还原事实，血液酒精检测报告是核心证据。

2. 程序合法性
   若公安机关在处罚或立案时存在程序违法（如未依法传唤、未告知权利），当事人可申请行政复议或提起行政诉讼，但需在知道处罚之日起60日内提出复议申请。

3. 主动配合的意义
   若当事人主动接受处罚或认罪认罚，可争取从轻处理（如罚款金额下限、缓刑）；若逃避调查，可能面临更严厉的处罚（如强制措施、信用惩戒）。

建议：若您或他人涉及此类情况，建议尽快咨询专业律师，结合具体证据（如酒精检测报告、行车记录）和情节（如是否发生事故、是否逃避检查）制定应对方案。