结论：饭店因强制多收3元打包费被罚1000元，这一处罚是否合法，需结合具体法律法规及地方性规定来判断，但通常情况下，若该行为违反了相关价格法规或消费者权益保护法规，且罚款数额在法定范围内，则该处罚是合法的。以下从多个角度进行分析：

一、法律依据分析

1. 《中华人民共和国价格法》：

   • 该法规定，经营者不得有相互串通，操纵市场价格，损害其他经营者或者消费者的合法权益；不得有捏造、散布涨价信息，哄抬价格，推动商品价格过高上涨等不正当价格行为。
   • 若饭店强制多收打包费，且未提前明确告知消费者，可能构成价格欺诈或不正当价格行为，违反了《价格法》的相关规定。

2. 《中华人民共和国消费者权益保护法》：

   • 该法规定，消费者享有知悉其购买、使用的商品或者接受的服务的真实情况的权利，以及自主选择商品或者服务的权利。
   • 饭店强制多收打包费，且未给予消费者选择权，可能侵犯了消费者的知情权和选择权，违反了《消费者权益保护法》的相关规定。

二、罚款合法性分析

1. 罚款依据：

   • 若饭店的行为确实违反了《价格法》或《消费者权益保护法》等相关法律法规，市场监管部门有权依据相关法律法规对其进行处罚。
   • 罚款数额的确定通常依据违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素，且需在法定罚款幅度内。

2. 罚款数额的合理性：

   • 对于强制多收3元打包费的行为，若市场监管部门认为其性质恶劣、情节严重或社会危害较大，且1000元的罚款数额在法定范围内，则该罚款数额是合理的。
   • 当然，如果地方性法规或规章对类似行为的罚款数额有具体规定，且1000元未超出该规定范围，则该罚款也是合法的。

三、实际操作中的考量

1. 地方性规定：

   • 不同地区可能对类似行为有具体的处罚规定或标准，因此在实际操作中，需结合当地的具体规定来判断罚款的合法性。

2. 证据收集与认定：

   • 市场监管部门在作出处罚决定前，需充分收集证据，证明饭店确实存在强制多收打包费的行为，且该行为违反了相关法律法规。
   • 饭店也有权进行陈述和申辩，市场监管部门需充分考虑其意见，确保处罚决定的公正性和合法性。

四、建议与后续行动

1. 对于消费者：

   • 若遇到类似情况，可保留相关证据（如收据、照片、视频等），并向市场监管部门投诉举报，维护自己的合法权益。

2. 对于饭店：

   • 应遵守相关法律法规，明确告知消费者打包费的收取标准和方式，给予消费者选择权，避免类似纠纷的发生。
   • 若对处罚决定有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，饭店因强制多收3元打包费被罚1000元，若该行为违反了相关法律法规且罚款数额在法定范围内，则该处罚是合法的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。