违法建筑的加工厂房是否算历史遗留问题，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 历史遗留问题的定义与范畴：

   • 历史遗留问题通常指的是在过去某个时期，由于政策、法规、管理等方面的原因，导致某些建筑或设施在建设时未取得合法手续，但因历史原因而一直存在，且未被相关部门明确认定为违法建筑或未被强制拆除的情况。

2. 违法建筑的定义：

   • 违法建筑是指未经规划、建设等部门批准，擅自建设的建筑物或构筑物。这类建筑通常违反了城市规划、土地管理等相关法律法规，因此被认定为违法。

3. 违法建筑加工厂房是否算历史遗留的分析：

   • 若加工厂房建设时间较早，且在当时未受到严格监管或未明确被认定为违法建筑：
     • 在这种情况下，如果加工厂房一直存在且未被相关部门强制拆除，它可能被视为历史遗留问题。但需要注意的是，即使被视为历史遗留问题，也并不意味着它自动获得了合法地位。在后续的城市规划、土地管理等方面，仍可能面临被整改或拆除的风险。
   • 若加工厂房建设时间较晚，或明确被相关部门认定为违法建筑：
     • 在这种情况下，加工厂房通常不会被视为历史遗留问题。相反，它可能会面临被相关部门强制拆除或要求整改的风险。因为违法建筑的存在违反了相关法律法规，且可能对城市规划、土地管理等方面造成不良影响。

4. 法律建议：

   • 对于加工厂房的所有者或使用者：
     • 如果加工厂房被认定为违法建筑或面临被拆除的风险，建议尽快咨询专业律师，了解相关法律法规和政策，评估自身权益和风险，并制定相应的应对策略。
     • 如果加工厂房可能被视为历史遗留问题，也建议咨询律师，了解相关政策法规和可能的处理方式，以便在后续的城市规划、土地管理等方面维护自身权益。
   • 对于相关部门：
     • 在处理违法建筑和历史遗留问题时，应遵循相关法律法规和政策，确保公平、公正、公开。同时，也应考虑历史原因和实际情况，采取合理的处理方式，避免对当事人造成不必要的损失。

总结来说，违法建筑的加工厂房是否算历史遗留问题，取决于其建设时间、是否受到严格监管、是否被明确认定为违法建筑等多个因素。在处理这类问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和应对策略。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。