商家无法证明货物来源是否违法，需根据具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 一般商业经营活动中的情况

   • 合法性判断：在小型商业经营活动或普通交易场景中，若法律法规未强制要求商家提供货源证明，商家单纯无法提供货源证明通常不构成违法行为。例如，个人出售闲置物品时，并不要求必须提供货源证明。
   • 法律后果：然而，若商家无法提供货源证明，且该商品存在质量问题或涉及侵权等违法行为，商家可能因无法证明商品来源的合法性而面临行政处罚或民事赔偿责任。根据《中华人民共和国产品质量法》等相关法规，商家可能因无法提供合法货源证明而被处以货值金额等值以下的罚款；有违法所得的，还将被没收违法所得。同时，若消费者因购买到假冒伪劣商品而遭受损失，商家需依据《中华人民共和国民法典》承担民事赔偿责任。

2. 特殊商品销售中的情况

   • 合法性判断：依据《药品管理法》《医疗器械监督管理条例》及《食品安全法》等法律法规，销售药品、医疗器械、食品等关系消费者生命健康安全的商品时，商家有义务建立并执行进货查验记录制度，留存进货凭证。若商家无法提供货源证明，则可能涉嫌违法。
   • 法律后果：对于无法提供货源证明的特殊商品销售者，可能面临警告、罚款、吊销许可证等严厉的行政处罚。例如，根据《中华人民共和国食品安全法》，无法提供货源证明的食品经营者可能面临责令改正、警告及高额罚款（如五万元以上五十万元以下）。情节严重的，还可能被责令停产停业或吊销许可证。

3. 知识产权保护领域的情况

   • 合法性判断：根据《商标法》《专利法》等知识产权法律法规，销售可能涉及知识产权的商品（如品牌商品、专利产品）时，商家有义务确保商品来源的合法性，并留存相关进货凭证。若商家无法提供合法的进货凭证，可能被认定为销售侵权商品。
   • 法律后果：销售侵权商品的商家需承担停止侵权、赔偿损失等侵权责任。根据《中华人民共和国商标法》，情节严重的还可能面临刑事处罚。

4. 市场监管部门检查中的情况

   • 合法性判断：在市场监管部门进行检查、调查时，若明确要求商家提供进货凭证以核实商品来源、质量等，商家有义务配合并提供相关凭证。若商家无正当理由拒绝或确实无法提供，可能会因违反相关程序性规定而面临行政处理措施。
   • 法律后果：商家可能因无法提供进货凭证而面临警告、罚款等行政处罚，甚至可能因情节严重而被吊销营业执照。

建议与预防措施：

• 保留凭证：商家应保存进货合同、协议、发票、收据等付款凭证，作为货源合法的初步证明。
• 查验资质：要求供应商提供营业执照、生产许可证等合法经营资质证明，并进行核实。
• 建立台账：建立并保存进货查验记录、销售记录等台账资料，确保进货来源可追溯。
• 了解法规：深入学习并遵守相关法律法规，确保经营行为合法合规。

商家无法证明货物来源是否违法，需根据具体情况判断。为了避免潜在的法律风险和经济损失，商家应严格遵守相关法律法规，采取有效措施确保进货来源的合法性。若您有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。