在非法经营罪的案件中，需要查清的关键要素主要包括以下几个方面：

1. 经营行为的非法性：

   • 首要的是确认被告人的经营行为是否违反了国家规定。这通常涉及对相关法律法规的深入理解和适用，比如是否未经许可经营专营、专卖物品，或者是否扰乱了市场秩序等。例如，未经许可销售烟草制品、药品等，就可能构成非法经营。

2. 经营行为的持续性：

   • 需要查清被告人的非法经营行为是否具有一定的持续性，而非偶尔的、一次性的行为。持续性的经营行为更能体现其对社会经济秩序的破坏程度，也是构成非法经营罪的重要条件之一。

3. 经营数额或违法所得：

   • 非法经营罪的成立往往与经营数额或违法所得的大小密切相关。因此，需要详细查清被告人的经营数额，包括销售额、进货额等，以及违法所得的具体数额。这些数据是判断犯罪情节严重程度的重要依据。例如，根据相关司法解释，非法经营数额达到一定标准或违法所得数额达到一定标准的，应认定为“情节严重”或“情节特别严重”。

4. 主观故意：

   • 非法经营罪是故意犯罪，因此需要查清被告人是否明知自己的经营行为违反国家规定，并仍然故意实施。这通常涉及对被告人主观心态的推断和证明，可以通过被告人的供述、证人证言、相关书证等证据来综合判断。

5. 社会危害性：

   • 除了上述客观要素外，还需要评估被告人的非法经营行为对社会经济秩序造成的实际危害程度。这包括对市场秩序的破坏、对消费者权益的侵害、对国家税收的损失等方面。社会危害性的大小也是判断犯罪情节严重程度和量刑的重要依据。

在查清这些关键要素的过程中，还需要注意以下几点：

• 证据的充分性和合法性：所有用于证明上述关键要素的证据都必须充分、合法，且能够形成完整的证据链。这要求侦查机关在收集证据时必须严格遵守法定程序，确保证据的客观性和真实性。
• 法律适用的准确性：在判断被告人的行为是否构成非法经营罪时，必须准确适用相关法律法规和司法解释。这要求办案人员具备扎实的法律功底和丰富的实践经验，能够准确理解法律条文的含义和适用范围。
• 量刑情节的考虑：在查清犯罪事实的基础上，还需要考虑被告人的量刑情节，如自首、立功、认罪态度等。这些情节可能对被告人的量刑产生重要影响。

若您或他人涉及非法经营罪的案件，建议及时向我咨询，以便更准确地了解案件情况，制定合适的辩护策略。