收入在总公司，成本在分公司是否合法，取决于具体的经营模式和会计处理方式，以及是否遵守了相关法律法规和会计准则。以下是对此问题的详细分析：

1. 从公司法务角度：

   • 总公司与分公司之间的收入和成本分配，应当遵循公平、合理、合法的原则，并确保符合公司法的相关规定。
   • 如果分公司是独立核算的法人实体，那么其成本和收入应当独立计算，并与总公司进行清晰的财务划分。
   • 如果分公司不是独立法人，而是总公司的分支机构，那么其成本和收入可以在总公司的统一核算下进行分配，但必须符合相关会计准则和税务规定。

2. 从会计和税务角度：

   • 会计上，收入和成本的确认应当遵循权责发生制原则，即收入应当与相关的成本、费用相匹配。
   • 税务上，不同国家和地区可能有不同的税收政策和规定，对于总公司和分公司之间的收入和成本分配，需要遵守当地的税收政策，并确保合法合规。
   • 如果收入和成本的分配不符合会计准则和税务规定，可能会导致税务风险、审计风险等问题。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，需要考虑总公司和分公司的具体经营模式、业务性质、合同安排等因素，以确定收入和成本的合理分配方式。
   • 如果存在跨地区经营的情况，还需要考虑不同地区的法律法规和会计准则的差异，并确保遵守相关规定。

综上所述，收入在总公司，成本在分公司是否合法，需要综合考虑多个因素，并确保符合相关法律法规和会计准则的要求。如果对此类问题存在疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供针对性的解答。