结论：是否赔偿需结合保险条款、事故原因及责任认定综合判断，可能存在以下两种情形：

1. 若保险条款明确覆盖“碰撞、意外事故导致的电池包损坏”
   根据《保险法》第12条，保险合同中明确约定的保险责任范围是理赔的核心依据。若您的车险（尤其是车损险）条款中明确包含“因碰撞、倾覆、外界物体坠落等原因导致车辆损失”的条款，且未将“碾压障碍物”列为免责情形，则保险公司应当理赔。
   关键点：需立即报案并保留现场证据（如拍照、报警记录），证明事故的突发性和不可预见性，避免被认定为“操作不当”。

2. 若存在免责情形或事故原因存疑
   若保险条款中明确将“因驾驶人故意或重大过失导致的事故”“未及时避让明显障碍物”等列为免责条款，或保险公司通过调查认定您未尽到合理注意义务（如明知前方有障碍物却未减速），则可能拒赔。
   法律依据：根据《保险法》第17条，保险公司对免责条款需尽到明确说明义务，若未提示或说明，该条款不生效；但若您存在故意或重大过失，保险公司仍可主张免责。

建议行动步骤：

1. 立即报案：事故发生后48小时内联系保险公司，说明事故经过并要求定损；
   
2. 固定证据：拍摄现场照片、视频，记录石头位置、车辆损坏部位，必要时报警获取《事故责任认定书》；
   
3. 审核条款：仔细查阅保险合同中的“保险责任”和“责任免除”章节，确认是否覆盖此类情形；
   
4. 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可先通过投诉（如向银保监会）或协商解决；若仍无果，可依据《保险法》第23条向法院起诉，要求保险公司履行赔付义务。

风险提示：若车辆未按时年检、驾驶人无证驾驶或酒驾，保险公司可能直接拒赔，此类情形属于法定免责事由。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体条款解读或理赔策略。