劳务派遣员工的产假工资主要由劳务派遣单位负责支付，但如果劳务派遣单位与用工单位在协议中有特别约定，且该约定不违反法律法规，则按约定执行。同时，若劳务派遣单位为员工缴纳了生育保险，产假期间的工资将由生育保险基金以生育津贴的形式支付。以下是对这一问题的详细分析：
一、工资发放主体
劳务派遣单位作为用人单位：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是法律上的用人单位，应履行对劳动者的义务，包括支付劳动报酬。因此，劳务派遣员工的工资，包括产假工资，原则上由劳务派遣单位发放。
用工单位的支付责任（基于约定）：
- 若劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中明确约定由用工单位支付产假工资，且该约定合法有效，则用工单位需承担支付责任。如无此约定或约定不明确，仍由劳务派遣单位支付。
生育保险基金的支付（符合参保条件）：
- 若劳务派遣单位为员工缴纳了生育保险，根据《中华人民共和国社会保险法》第五十四条，产假期间的工资将由生育保险基金以生育津贴的形式支付。生育津贴通常按照用人单位上年度职工月平均工资的标准发放。
二、产假工资发放标准
已参加生育保险：
- 生育津贴由生育保险基金支付，标准通常为用人单位上年度职工月平均工资。若女职工产假前的工资高于这一标准，差额部分可能由用人单位补足（具体根据地方规定执行）。
未参加生育保险：
- 由劳务派遣单位按照女职工产假前的工资标准支付产假工资。劳务派遣单位应确保产假工资不低于当地最低工资标准，以保障女职工的基本生活需求。
三、工资发放保障
按时足额支付：
- 劳务派遣单位应按照劳动合同约定的工资数额、支付方式和支付周期等发放产假工资。若因特殊情况需延迟支付，应提前与女职工协商并取得其同意。
劳动者权益保护：
- 若劳务派遣单位未依法发放产假工资，女职工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。用工单位在发现劳务派遣单位未依法支付产假工资时，也有义务督促其及时整改。
四、实际操作建议
明确约定：
- 在劳务派遣协议中，应明确约定被派遣劳动者在产假期间的工资支付方式和标准，以避免双方因责任不清而产生纠纷。
及时沟通：
- 当被派遣劳动者提出产假申请时，劳务派遣单位和用工单位应及时沟通并协商确定产假工资的支付事宜，确保女职工能够顺利享受产假待遇。
依法支付：
- 劳务派遣单位和用工单位应严格按照法律法规和劳务派遣协议的约定，及时足额支付被派遣劳动者在产假期间的工资，以维护女职工的合法权益。
举例说明：假设某劳务派遣单位与用工单位签订了劳务派遣协议，并约定由用工单位支付被派遣劳动者的产假工资。同时，该劳务派遣单位也为被派遣劳动者缴纳了生育保险。在这种情况下，若被派遣劳动者休产假，其产假工资应由用工单位支付（根据协议约定），但生育津贴仍由生育保险基金支付。若用工单位未按照协议约定支付产假工资，被派遣劳动者可向劳务派遣单位或劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。
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