入股亏了由公司承担并不合法，一般情况下，入股后的亏损应由股东自行承担。以下从不同角度进行详细分析：

1. 公司法的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。股东以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。这意味着，股东入股后，其责任限于其出资额或股份，公司亏损时，股东并不需要额外承担公司亏损的责任，除非存在股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的情况。

2. 入股协议与合同条款：

   • 入股时，股东与公司之间会签订入股协议或相关合同，其中会明确双方的权利和义务。通常情况下，这些协议或合同会规定股东按照其出资比例分享公司利润，并承担相应风险。因此，除非协议或合同中有特别约定（如保底条款等，但此类条款可能因违反公司法原则而被认定为无效），否则股东需要自行承担入股后的亏损。

3. 特殊情况下的责任承担：

   • 如果股东存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的行为，根据《公司法》第二十条的规定，股东应当对公司债务承担连带责任。但这并不意味着股东需要承担公司的全部亏损，而是针对特定债务承担连带责任。
   • 另外，如果公司存在违法违规行为，导致股东权益受损，股东可以通过法律途径追究公司或相关责任人的法律责任，但这并不改变股东自行承担入股亏损的基本原则。

4. 实际操作中的建议：

   • 在入股前，股东应充分了解公司的经营状况、财务状况和风险情况，评估入股的风险和收益。
   • 签订入股协议或相关合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于风险承担和利润分配的条款，确保自己的权益得到保障。
   • 如果对入股协议或合同条款存在疑问或不确定的地方，应及时咨询专业律师或法律顾问的意见。

总结来说，入股亏了由公司承担并不合法，股东应自行承担入股后的亏损。当然，如果存在特殊情况或协议中的特别约定，可能需要具体分析。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。