关于网贷逾期被起诉后还上款项能否申请退款的问题，结论是：一般情况下，款项一旦偿还，无法直接申请“退款”，但具体能否有相关操作空间，需结合实际情况分析。 以下从不同角度为你详细阐述：
一、从法律程序与合同履行角度
合同履行完毕：网贷逾期后，你与网贷平台之间存在借款合同关系。当你被起诉后，若你偿还了全部或部分款项，这通常被视为你履行了合同中的还款义务。一旦款项到账，合同中的还款义务即告完成，从法律程序上讲，不存在“退款”的基础，因为款项是用于偿还你欠平台的债务。
诉讼目的达成：网贷平台起诉你的目的，通常是为了追回逾期款项。当你偿还了款项，平台的诉讼目的已经达成，此时平台一般会向法院申请撤诉或等待法院作出有利于你的判决（如确认债务已清偿）。但撤诉或判决并不涉及“退款”问题。
二、从特殊情况与协商角度
多还款项：如果你在偿还过程中，不小心多还了款项给网贷平台（例如，因计算错误或操作失误导致），那么你有权要求平台退还多还的部分。这种情况下，你可以与平台协商，提供相关证据（如转账记录、还款计划等），要求平台退还多收的款项。
协商和解：在诉讼过程中，如果你与网贷平台达成了和解协议，且协议中明确约定了退款条款（如平台同意在收到款项后的一定时间内退还你部分费用作为和解条件），那么你可以依据和解协议要求平台退款。但这种情况较为特殊，需要双方有明确的约定。
三、从信用修复与后续影响角度
信用记录：即使你偿还了逾期款项，这次逾期记录可能已经对你的信用产生了不良影响。根据相关规定，逾期记录会在你的信用报告中保留一段时间（如五年）。在此期间，你可能需要采取一些措施来修复信用，如按时履行其他债务、保持良好的信用行为等。
再次起诉风险：如果你后续再次出现逾期违约行为，网贷平台仍有权再次提起诉讼。因此，在偿还完当前逾期款项后，你应严格遵守与网贷平台的约定，避免再次陷入法律纠纷。
四、建议与注意事项
保留证据：无论你是否多还款项或达成和解协议，都应保留好相关证据（如转账记录、还款计划、和解协议等），以备不时之需。
及时沟通：如果你对还款金额、退款问题或信用修复等方面有疑问或需求，应及时与网贷平台沟通，寻求解决方案。
咨询专业意见：如果你在处理网贷逾期问题时遇到复杂情况或法律纠纷，建议及时向我咨询，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，网贷逾期被起诉后还上款项，一般情况下无法直接申请“退款”。但如果你存在多还款项或与平台达成和解协议等特殊情况，可以依据相关规定和约定要求平台退款。同时，你也应关注自己的信用记录和后续法律风险，采取必要措施维护自己的合法权益。