协议一式一份在特定情况下是合法的，但通常不建议仅制作一份协议。以下从不同角度为你详细分析：

合法性角度

1. 法律未明确禁止：从现行法律法规来看，并没有明确规定协议必须一式几份才具有法律效力。只要协议内容合法、双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等情形，即使协议仅制作一份，在双方当事人签字或盖章后，也是具有法律效力的。

2. 合同成立与生效要件：合同的成立和生效主要取决于双方当事人的意思表示是否一致，以及合同内容是否合法。只要满足这些条件，无论协议制作几份，都不会影响其法律效力。

风险与建议角度

1. 风险：

   • 证据留存问题：如果协议仅制作一份，且由一方当事人保管，那么在发生纠纷时，另一方当事人可能难以获取协议原件作为证据，从而增加其维权难度。
   • 协议修改与补充问题：在协议履行过程中，如果需要对协议进行修改或补充，仅有一份协议可能会给双方带来不便，甚至可能引发新的纠纷。

2. 建议：

   • 制作多份协议：为了降低风险，建议双方当事人在签订协议时，至少制作两份原件，双方各执一份。这样，在发生纠纷时，双方都能提供协议原件作为证据，有利于维护各自的合法权益。
   • 明确协议保管责任：如果确实需要制作一份协议，那么双方应当在协议中明确约定协议的保管责任，以及发生纠纷时如何获取协议原件等事项，以减少潜在的风险。

实际应用角度

在实际操作中，协议一式一份的情况并不常见。因为大多数情况下，双方当事人都会希望保留一份协议原件作为证据，以备不时之需。特别是在涉及重要权益的协议中，如房屋买卖合同、借款合同等，双方更是会谨慎对待协议的制作和保管问题。

总结来说，虽然协议一式一份在特定情况下是合法的，但考虑到证据留存、协议修改与补充等风险，建议双方当事人在签订协议时制作多份原件，并各自妥善保管。如果你在协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。