不会扣女方的工资。夫妻分居多年，男方因犯诈骗罪被判刑并需要交纳罚金，但这与女方的工资无关。以下是对此问题的详细分析：

1. 夫妻财产独立性：

   • 在法律上，夫妻双方的财产具有一定的独立性。男方的犯罪行为和由此产生的罚金责任，原则上只由男方个人承担，不会直接涉及到女方的财产。

2. 罚金执行原则：

   • 罚金的执行通常针对被判刑人个人的财产。如果男方无法交纳罚金，法院会依据相关法律规定，通过冻结银行账户、查封财产等方式来追缴，但这一过程不会涉及女方的工资或财产。

3. 特殊情况说明：

   • 除非有证据证明女方的工资或财产与男方的犯罪行为有直接关联，或者女方自愿为男方承担罚金责任，否则女方的工资不会被扣除用于支付男方的罚金。

4. 法律建议：

   • 如果女方担心自己的财产受到牵连，可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律风险。
   • 同时，男方也应积极面对自己的法律责任，尽力筹集资金交纳罚金，以避免不必要的法律后果。

综上所述，夫妻分居多年，男方犯诈骗罪判刑罚金交不起，不会扣女方的工资。如有其他法律问题或需要进一步咨询，请随时向我提问。