不填三方协议，通常是可以毕业的。以下从多个角度为你详细分析：

毕业条件的法定性

根据《普通高等学校学生管理规定》，学生毕业的条件主要包括修完教育教学计划规定内容、成绩合格、达到学校毕业要求，并在德、智、体、美、劳等方面达到相应标准。这些条件是判断学生是否具备毕业资格的唯一依据。三方协议，作为明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业中权利和义务的书面文件，它与学生是否完成学业、是否达到毕业标准并无直接关联。因此，学校不能将提交三方协议作为毕业的必要条件。

学校行为的合法性评估

若学校以学生不签订三方协议为由拒绝颁发毕业证书，这一行为很可能违反了《中华人民共和国教育法》和《普通高等学校学生管理规定》。这些法律法规明确规定，学校应当为学生颁发相应的学业证书，且不得违反国家规定向学生收取费用或附加其他不合理条件。此外，学校的这种做法还可能侵犯了学生的自主选择就业权，学生有权利根据自己的意愿选择是否签订三方协议，学校应尊重这一权利。

特殊情况的处理

尽管一般情况下学校不能以三方协议为毕业条件，但在某些特定情况下，如学校将三方协议的签订作为实习或就业环节的一部分，并明确纳入毕业要求中时，学生未能签订可能会影响其实习或就业的顺利进行，进而间接影响毕业。然而，这并不意味着学校可以以此为由拒绝颁发毕业证书。在这种情况下，学生仍应通过与学校沟通协商、向上级教育主管部门反映或寻求法律援助等方式来维护自己的合法权益。

学生应对措施

1. 积极沟通协商：首先尝试与学校进行沟通，说明相关法律法规和毕业条件的实际情况，要求学校按照正常的毕业条件为学生办理毕业手续。
2. 寻求上级帮助：如果与学校沟通无果，可以向学校的上级教育主管部门进行反映和投诉，请求其介入调查并给出公正处理。
3. 法律途径维权：在必要时，学生可以寻求法律援助或向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的合法权益。

总结来说，不填三方协议通常不会影响你的毕业资格。能否毕业主要取决于你是否满足了学校的学业要求。如果你在毕业过程中遇到任何问题或困惑，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。