结论：在父母打算将公司部分股权转让给女儿，但儿子不同意的情况下，这主要涉及到家庭内部的财产分配和股权转让的法律问题。具体如何处理，需根据公司的性质（如是否为有限责任公司、股份有限公司等）、家庭内部的协议或遗嘱、以及相关法律法规来综合判断。以下是从不同角度给出的详细分析：
公司性质与股权转让规则：
- 如果公司是有限责任公司，根据《公司法》的相关规定，股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。在此情况下，若儿子是公司股东，他对于股权转让有一定的表决权。但若父母只是将股权转让给女儿（假设女儿也是股东或父母保留足够股权以维持控制权），且不涉及外部转让，则儿子的不同意可能不构成直接的法律障碍，除非公司章程有特别规定。
- 如果公司是股份有限公司，股权转让通常更为自由，尤其是当股权在证券交易所上市交易时。但即便如此，家庭内部的股权转让仍可能受到公司章程、股东协议或家庭内部协议的限制。
家庭内部协议或遗嘱：
- 如果父母之前已经与子女们签订了家庭内部协议，明确了公司股权的分配方式或转让条件，那么该协议将具有法律约束力。在这种情况下，即使儿子不同意，只要协议内容合法且未违反公序良俗，父母仍有权按照协议将股权转让给女儿。
- 如果父母留下了遗嘱，指定了公司股权的继承人，那么遗嘱的效力将优先于法定继承。但遗嘱的效力也受到一定限制，如必须为缺乏劳动能力又没有生活来源的继承人保留必要的遗产份额等。
法律建议与解决方案：
- 沟通协商：首先，建议家庭成员之间进行充分的沟通协商，尝试达成一致意见。这有助于维护家庭关系的和谐，并避免不必要的法律纠纷。
- 修改公司章程或股东协议：如果公司章程或股东协议对股权转让有特别限制，且这些限制与父母的转让意愿相冲突，可以考虑修改相关条款。但修改章程或协议需要遵循一定的法律程序，如召开股东会、获得必要比例的股东同意等。
- 寻求法律援助：如果家庭成员之间无法达成一致意见，或者存在复杂的法律问题，建议寻求专业的法律援助。作为专业律师，我可以根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。
可能的法律后果：
- 如果父母未经其他股东同意（在有限责任公司中）或违反公司章程、股东协议的规定擅自转让股权，可能会面临法律纠纷和股权转让无效的风险。
- 如果儿子认为自己的合法权益受到侵害，他可以通过法律途径维护自己的权益，如提起诉讼要求确认股权转让无效或要求赔偿损失等。
进一步思考：在处理此类家庭财产纠纷时，除了考虑法律因素外，还应充分考虑家庭关系的维护和和谐。因此，在采取任何法律行动之前，建议家庭成员之间进行充分的沟通和协商，尝试通过和解或调解的方式解决问题。如果确实无法达成一致意见，再考虑通过法律途径解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。