结论：在对方标书出现废标项却已中标的情况下，您可以通过核查废标项性质、收集证据、依据招标文件及法律法规提出质疑，并考虑通过投诉或法律途径解决。以下是对此问题的详细分析：

一、核查废标项的性质与影响

1. 明确废标项定义：首先，需要明确“废标项”在招标文件中的具体定义和范围。废标项通常指的是那些不符合招标文件要求，导致投标被视为无效或应被拒绝的条款或条件。

2. 评估废标项对中标结果的影响：接着，要评估这些废标项是否实质上影响了中标结果。如果废标项并不构成实质性违反招标文件要求，或者对中标结果无实质性影响，那么质疑可能难以成立。

二、收集证据

1. 获取招标文件与中标公告：收集完整的招标文件、中标公告以及对方的投标文件，以便对比分析。

2. 记录废标项：详细记录对方标书中出现的废标项，包括具体条款、违反情况等。

3. 收集其他证据：如有必要，还可以收集其他相关证据，如专家意见、行业规范等，以支持您的质疑。

三、提出质疑

1. 依据招标文件：根据招标文件中的相关规定，指出对方标书中存在的废标项，并说明这些废标项如何违反了招标文件的要求。

2. 引用法律法规：在质疑中，可以引用相关的法律法规，如《中华人民共和国招标投标法》等，来支持您的观点。例如，根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，投标文件应当对招标文件提出的实质性要求和条件作出响应。如果对方标书中的废标项构成了对招标文件实质性要求的违反，那么其中标结果可能应被视为无效。

3. 书面质疑：将质疑以书面形式提交给招标人或相关监管机构，并要求对方在规定时间内给予答复。

四、考虑后续行动

1. 投诉与举报：如果招标人或相关监管机构未能在规定时间内给予合理答复，或者您认为处理结果不公正，可以考虑向更高层次的监管机构投诉或举报。

2. 法律途径：在必要时，您还可以考虑通过法律途径解决争议，如提起行政诉讼或民事诉讼等。不过，在采取法律行动前，请务必咨询专业律师以评估风险和可行性。

五、注意事项

1. 及时行动：在发现对方标书存在废标项后，应尽快提出质疑，以免错过时效期限。

2. 保持专业与理性：在质疑过程中，应保持专业和理性的态度，避免情绪化或攻击性的言论。

3. 寻求专业支持：如果您对招标流程、法律法规等方面不熟悉，建议寻求专业律师或招标代理机构的支持。

如果您在处理此类问题时遇到任何困难或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。