针对您提出的“保密二级资格证法人换了怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
当武器装备科研生产单位的法定代表人发生变更时，您需要按照以下步骤来处理保密二级资格证的变更事宜：
一、准备变更材料
保密资格证书变更申请书：这是申请变更的正式文件，需要详细填写变更原因、变更内容等信息。
法人代表任免通知或董事会决议：这是证明新法人代表任职的有效文件，需要提供原件或复印件，并加盖单位公章。
企业法人营业执照或事业单位法人证书复印件：这是证明单位合法身份的文件，需要提供变更后的最新版本。
保密资格证书复印件（正副本）：这是您当前持有的保密资格证书，需要提供正副本的复印件。
法人代表身份证复印件（正反面）：这是新法人代表的身份证明文件，需要提供正反面的复印件。
二、提交变更申请
您需要将准备好的变更材料提交至作出审批决定的行政机关，对于保密二级资格证，通常是提交至陕西省军工保密资格认定办公室受理窗口（若您所在地区有特殊规定，请按照当地规定执行）。提交时，请确保材料齐全、准确，并按照要求填写相关表格。
三、等待审核与批准
行政机关在收到您的变更申请后，会进行审查。审查过程中，可能会要求您补充相关材料或进行现场核查。请保持联系方式畅通，以便及时接收行政机关的通知。一旦审核通过，行政机关会重新颁发保密资格证书，并注明新的法定代表人信息。
四、注意事项
变更时限：根据相关规定，您需要在法定代表人变更后5个工作日内向行政机关提交变更申请。请务必注意时限，以免错过申请时间。
材料真实性：您提交的所有材料必须真实、准确、完整。如有虚假材料或隐瞒重要信息，可能会导致变更申请被拒绝或受到其他处罚。
后续管理：变更完成后，您需要按照新的保密资格证书要求，加强单位的保密管理工作，确保国家秘密的安全。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在变更过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时联系行政机关或咨询专业人士。